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用于预测肺癌患者胸部放疗后放射性肺炎发生风险的多组学系统及其应用 

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申请/专利权人:中国医学科学院肿瘤医院

摘要:本发明公开了用于预测肺癌患者胸部放疗后放射性肺炎发生风险的多组学系统及其应用。本发明提供了检测19个SNP位点基因型的物质、存储模型公式的介质和检测4个剂量组学特征的物质在制备预测肺癌患者放疗治疗疗效产品中的应用。本发明构建了基于基因组学和剂量组学的多组学RP综合预测模型,经过验证提示模型预测效能良好。该模型有助于预测接受胸部放疗患者放射性肺炎发生的风险。本发明具有重要的应用价值。

主权项:1.检测19个SNP位点基因型的物质、存储模型公式的介质和检测4个剂量组学特征的物质在如下任一中的应用:1制备预测肺癌患者放疗治疗疗效产品;2制备用于接受胸部常规分割放疗肺癌患者放射性肺炎发生风险评估的产品;所述4个剂量组学特征为ipi_wavelet.HHL_firstorder_Mean、ipi_logarithm_glcm_ClusterShade、ipi_wavelet.HLL_ngtdm_Contrast、lat_wavelet.HHH_firstorder_Median;所述19个SNP位点及其对应基因型如下:LIPA-rs1051338位点对应基因型TT、GT、GG;APEX1-rs1130409位点对应基因型TT、GT、GG;MMP1WTAPP1-rs1144393位点对应基因型TT、CT、CC;ZNF638-rs11542286位点对应基因型CC、TT,PCDH12-rs164074位点对应基因型GG、AG、AA,PCDH12-rs164515位点对应基因型CC、CT、TT,KIAA201-rs16838742位点对应基因型GG、CG、CC,IL13-rs180925位点对应基因型AA、AC、CC,NOS2-rs2297518位点对应基因型GG、AG、AA;MYO9A-rs2415128位点对应基因型TT、CT、CC,CAPN9-rs28359631位点对应基因型AA、AG、GG,CCR6-rs3093007位点对应基因型TT、CT、CC,OBSCN-rs56168609位点对应基因型GG、CG、CC,STXBP2-rs61407177位点对应基因型CC、CT、TT,VSIG10-rs67405503位点对应基因型AA、AT、TT,ZXDC-rs6775965位点对应基因型AA、AC、CC,KDM7A-rs6950119位点对应基因型GG、GT、TT,TENM3rs7654255位点对应基因型TT、CT、CC,EPHA6rs9835140位点对应基因型CC、CT、TT;所述模型公式如式1所示: 其中,m是SNP的个数,vi表示第1个SNP突变至第18个SNP突变位点的内积值,vj表示第2个SNP突变至第19个SNP突变位点的积值;所述内积值为根据各个SNP的基因型计算获得。

全文数据:

权利要求:

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