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申请/专利权人：广东省农业科学院作物研究所

摘要：本发明公开了一种检测甜玉米籽粒alpha‑生育酚含量的ZmCS2基因、位点及其应用，包括位于甜玉米基因组1号染色体的6,246,230位置,36,246,245位置，36,246,279位置，36,246,672位置，36,246,703位置，36,247,066位置,36,247,456位置,36,249,909位置,36,254,984位置,36,255,010位置和36,256,682位置的SNP位点，所述SNP位点与alpha‑生育酚含量显著相关。本发明开发的KASP引物具有高度灵活性，可以快速完成少量及大量甜玉米材料基因型的检测，可以将高alpha‑生育酚含量甜玉米材料快速筛选。

主权项：1.甜玉米基因组1号染色体上基因ZmCS2位点的应用，所述甜玉米基因组为基因组B73，v4版本，ID为Zm00001d028477，其特征在于：包括以下SNP位点：1）甜玉米基因组1号染色体的36,246,230位置的SNP位点，多态性为GC,有利等位基因为C；2）甜玉米基因组1号染色体的36,246,245位置的SNP位点，多态性为CA,有利等位基因为A；3）甜玉米基因组1号染色体的36,246,279位置的SNP位点，多态性为CT,有利等位基因为T；4）甜玉米基因组1号染色体的36,246,672位置的SNP位点，多态性为TG,有利等位基因为G；5）甜玉米基因组1号染色体的36,246,703位置的SNP位点，多态性为AC,有利等位基因为C；6）甜玉米基因组1号染色体的36,247,066位置的SNP位点，多态性为GA,有利等位基因为A；7）甜玉米基因组1号染色体的36,247,456位置的SNP位点，多态性为AG,有利等位基因为G；8）甜玉米基因组1号染色体的36,249,909位置的SNP位点，多态性为CG,有利等位基因为G；9）甜玉米基因组1号染色体的36,254,984位置的SNP位点，多态性为GT,有利等位基因为T；10）甜玉米基因组1号染色体的36,255,010位置的SNP位点，多态性为GT,有利等位基因为T；11）甜玉米基因组1号染色体的36,256,682位置的SNP位点，多态性为AT,有利等位基因为T；所述SNP位点与alpha-生育酚含量显著相关。

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