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RNA介导的染色质构象捕获方法 

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申请/专利权人:南方科技大学

摘要:本发明涉及一种RNA介导的染色质构象捕获方法。该RNA介导的染色质构象捕获方法,巧妙地利用反转录将BrdU引入靶标位点,结合BrdU抗体就能够简便有效地对靶标位点进行富集,并且能够广泛适用于RNA介导的染色质构象的捕获中,不需要针对特定RNA设计特定的带有标记的探针,极大地降低了成本。此外,通过将邻近连接技术引入RNA介导的染色质构象捕获领域,将在同一染色质复合物中与RNA密切相关的DNA位点进行连接,可以获得目标RNA介导的DNA位点的交互信息和互作网络。

主权项:1.一种RNA介导的染色质构象捕获方法,其特征在于,包括以下依次进行的步骤:采用交联剂对细胞进行交联;对细胞进行细胞裂解和细胞核裂解;将经过细胞核裂解的细胞的染色质进行片段化;对结合在染色质上的目标RNA进行反转录,其中,在反转录所需的dNTP中掺入BrdU;对片段化的染色质的DNA进行末端加尾;对染色质进行邻近连接;将邻近连接后的染色质进行破碎;采用带有BrdU抗体的磁珠富集邻近连接后的染色质;对染色质进行解交联,并纯化DNA;及对纯化后的DNA进行切割和建库测序,并进行数据分析,得到目标RNA介导的染色质构象。

全文数据:

权利要求:

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