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B型牛库布病毒实时荧光定量检测方法 

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申请/专利权人:云南农业大学

摘要:本发明属于病毒检测领域,提供了B型牛库布病毒实时荧光定量检测方法,包括以下步骤:确定特异性引物:针对BKV3D基因的保守区域,采用一对特异性引物;核酸提取及反转录:用TrizolReagent法提取总RNA,将RNA核酸反转录成cDNA,并保存于‑20℃;制备阳性标准品:用BKV的cDNA为模板,使用引物进行PCR反应及电泳检测,对PCR鉴定为阳性的克隆质粒测序,并构建出重组质粒,将测序结果正确的重组质粒作为模板;反应体系及条件的优化:反应体系为20μL体系,其对0.2~0.6μL引物浓度和57~64℃退火温度进行优化;建立标准曲线;本发明通过建立BKV实时荧光定量PCR检测方法,该方法操作简单、特异性强、敏感性高、重复性好,为BKV感染的临床诊断及分子流行病学调查提供了技术支撑。

主权项:1.B型牛库布病毒实时荧光定量检测方法,其特征在于:包括以下步骤:S1、确定特异性引物:针对BKV3D基因的保守区域,设计合成一对特异性引物,分别为BKV-F和BKV-R,所述BKV-F引物序列为CGAAGATTATCTCGTGAAA;所述BKV-R引物序列为GCTGACAGGACACAGATG;S2、核酸提取及反转录:用TrizolReagent法提取总RNA,按照反转录试剂盒说明书的方法将RNA核酸反转录成cDNA,并保存于-20℃;S3、制备阳性标准品:用BKV的cDNA为模板,使用S1中的引物进PCR反应及电泳检测,做胶回收纯化目的片段,将目的片段连接于PMD19-T载体,转化至DH5α大肠杆菌感受态细胞,涂布于含氨苄青霉素抗性的LB固体培养基上过夜培养,进行蓝白斑筛选,挑选出白色单克隆菌落,于含氨苄青霉素抗性液体培养基中增菌,将PCR鉴定为阳性的克隆质粒测序,并构建出重组质粒,将测序结果正确的重组质粒作为模板;S4、反应体系及条件的优化:反应体系为20μL体系,即TBGreenPremixExTaqⅡ10μL,BKV阳性标准品2.0μL;其对0.2~0.6μL引物浓度和57~64℃退火温度进行优化;S5、建立标准曲线:将质粒进行10倍倍比稀释,得到1×101~1×109copiesL9个不同拷贝数的标准品,按照优化后的反应条件进行扩增,以拷贝数的对数为横坐标,Ct值为纵坐标,绘制标准曲线。

全文数据:

权利要求:

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