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申请/专利权人：中国科学技术大学
摘要：本发明属于蛋白质工程改造技术领域，公开了一种基于分子动力学模拟获取RSVF突变体的方法，首先使用分子动力学模拟软件对RSVF蛋白变异体进行模拟，并使用可视化软件和分子动力学模拟软件分析RSVF蛋白变异体的运动路径，计算RMSF值，结合本领域内RSV相关文献，确定RSVF蛋白变异体的突变序列；使用UCSFChimera软件对RSVF蛋白变异体进行突变处理，然后使用分子动力学模拟软件对RSVF蛋白变异体进行模拟，分析RSVF蛋白变异体的运动路径，通过分析RMSF和RMSD验证该蛋白变异体的稳定性。本发明用于通过分子动力学模拟手段获取稳定的RSVF蛋白突变体，并构建RSVF蛋白变异体的结构模型，结合从头设计、计算机虚拟筛选和高通量筛选，很大程度节省了湿实验成本。
主权项：1.一种基于分子动力学模拟获取RSVF突变体的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、使用分子动力学模拟软件中的动力学模拟模块对RSVF蛋白变异体进行模拟，获得RSVF蛋白变异体的运动路径；S2、使用VMD可视化软件和分子动力学模拟软件中的分析模块分析RSVF蛋白变异体的运动路径，通过模拟RSVF蛋白变异体的动力学参数计算RMSF值，分析RSVF蛋白变异体氨基酸的柔性，以及RSVF蛋白变异体柔性与抗原识别位点的关系；S3、结合本领域内RSV相关文献和结构生物学原理，确定RSVF蛋白变异体的突变序列；S4、使用UCSFChimera软件对RSVF蛋白变异体进行突变处理，然后使用分子动力学模拟软件中的动力学模拟模块对设计的RSVF蛋白变异体进行模拟，并结合VMD可视化软件和分子动力学模拟软件中的分析模块分析RSVF蛋白变异体的运动路径，通过分析RMSF和RMSD来验证该蛋白变异体的稳定性。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学技术大学 基于分子动力学模拟获取RSV F突变体的方法
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