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申请/专利权人:武汉金域医学检验所有限公司
摘要:本发明涉及遗传学检验领域,揭露了一种基因组拷贝数变异自动化分析方法及系统,其中,所述方法包括:基于拷贝数采集窗口接收拷贝数变异数据,将拷贝数变异数据发送至预构建的本地数据库,基于数据传输单元确认已完整接收拷贝数变异数据,利用检索数据库构建标准文本集,从所述标准文本集中依次提取标准文本,基于所提取的标准文本、预构建的文本相似度计算公式计算相似度值,得到相似度集,利用预设的相似度阈值对相似度集执行筛选操作,得到优化相似度集,基于优化相似度集及分析报告单元完成基因组拷贝数变异自动化分析。本发明主要目的在于解决了利用文本比对进行拷贝数变异数据检索,并根据文本比对结果对检索结果进行优化的问题。
主权项:1.一种基因组拷贝数变异自动化分析方法,其特征在于,所述方法包括构建拷贝数采集窗口,基于拷贝数采集窗口接收拷贝数变异数据,将拷贝数变异数据发送至预构建的本地数据库,其中,拷贝数变异数据包括染色体编号、上游位置、下游位置及拷贝数,本地数据库包括:数据传输单元,文本处理单元及分析报告单元;基于数据传输单元确认已完整接收拷贝数变异数据,其中,所述数据传输单元包括:缓存单元、监测单元及反馈单元,利用拷贝数变异数据及文本处理单元获取拷贝数变异数据对应的待检索文本;利用预构建的检索数据库构建标准数据集,基于标准数据集获取标准文本集,其中,所述标准数据集中包括多个标准数据,标准数据与检索数据库中预构建的检索结果一一匹配,所述标准文本集中包括多个标准文本,所述标准文本与标准文本对应的标准数据一一对应;基于预构建的文本比对单元从所述标准文本集中依次提取标准文本,基于所提取的每一个标准文本、预构建的文本相似度计算公式与待检索文本计算相似度值,得到多个相似度值;汇总多个相似度值并对所述多个相似度值执行排序操作,得到相似度集,其中,对相似度集中的所有相似度值执行了降序排序操作;利用预设的相似度阈值对相似度集执行筛选操作,得到优化相似度集;基于优化相似度集及分析报告单元获取分析报告;将分析报告发送至预构建的报告查阅单元,基于报告查阅单元完成基因组拷贝数变异自动化分析。
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