首页 专利交易 科技果 科技人才 科技服务 国际服务 商标交易 会员权益 IP管家助手 需求市场 关于龙图腾
 /  免费注册
到顶部 到底部
清空 搜索

一种等位基因的信息化鉴定方法 

买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!

申请/专利权人:北京智能前行科技有限公司

摘要:本发明涉及基因数据处理技术领域,提出了一种等位基因的信息化鉴定方法,包括:获取待鉴定基因碱基序列、比对基因碱基序列;采用序列匹配算法获取待鉴定基因碱基序列与比对基因碱基序列的基因相似得分系数;根据待鉴定二级序列与比对碱基二级序列之间碱基的匹配特征获取序列匹配得分系数以及基因差异反馈系数;根据基因差异反馈系数获取待鉴定匹配碱基序列与比对匹配碱基序列之间的基因吻合优异指数;根据基因吻合优异指数的取值情况以及等位基因类别关联指数获取等位特征向量;采用聚类算法得到比对基因碱基序列的分类结果;根据分类结果得到等位基因的鉴定结果。本发明避免两个基因序列的相同位点碱基直接匹配导致等位基因鉴定精度低的问题。

主权项:1.一种等位基因的信息化鉴定方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:分别获取待鉴定基因碱基序列、比对基因碱基序列;采用尼德曼-翁施Needleman-Wunsch算法获取待鉴定匹配碱基序列与每个比对匹配碱基序列的基因相似得分系数;采用均匀分段的方式将待鉴定匹配碱基序列、每个比对匹配碱基序列分别划分成相同长度的待鉴定二级序列、比对碱基二级序列;根据待鉴定二级序列与比对碱基二级序列之间碱基的匹配特征获取待鉴定二级序列与比对碱基二级序列之间的序列匹配得分系数;根据待鉴定匹配碱基序列与每个比对匹配碱基序列之间所述二级序列之间的序列匹配得分系数获取待鉴定匹配碱基序列与每个比对匹配碱基序列之间的基因差异反馈系数;根据待鉴定匹配碱基序列与所有比对匹配碱基序列之间的基因差异反馈系数获取待鉴定匹配碱基序列与每个比对匹配碱基序列之间的基因吻合优异指数;根据所述基因吻合优异指数以及每个比对匹配碱基序列的等位基因组获取待鉴定匹配碱基序列与每个比对匹配碱基序列之间的等位基因类别关联指数;根据每个比对匹配碱基序列对应的基因吻合优异指数的取值情况获取每个比对基因碱基序列的等位特征向量;采用聚类算法基于所述等位特征向量得到所有比对基因碱基序列的分类结果;根据所述分类结果得到待鉴定基因碱基序列的等位基因的鉴定结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 北京智能前行科技有限公司 一种等位基因的信息化鉴定方法

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。