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甲型流感病毒分型的计算机装置、方法和计算机可读存储介质 

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申请/专利权人:北京化工大学

摘要:本发明公开了甲型流感病毒分型的计算机装置、方法和计算机可读存储介质。所要解决的技术问题是如何基于甲型流感病毒H亚型和N亚型的基因序列快速准确地对甲型流感病毒进行分型。本发明以已知H亚型和N亚型的甲型流感病毒HA基因的核苷酸序列数据和NA基因的核苷酸序列数据作为训练数据,来训练甲型流感病毒分型模型;所述样本数据输入甲型流感病毒分型模型后通过所述甲型流感病毒分型模型得到待测甲型流感病毒的H亚型和N亚型。本发明的方法是基于深度学习对甲型流感病毒序列的预测分析,可作为传统实验室鉴定生物实验的有益补充,实现快速的亚型鉴定。

主权项:1.计算机装置,其包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤:S1、构建甲型流感病毒分型模型:以已知H亚型和N亚型的甲型流感病毒HA基因的核苷酸序列数据和NA基因的核苷酸序列数据,来训练甲型流感病毒分型模型,所述甲型流感病毒分型模型为CNN卷积神经网络模型,所述CNN模型采用学习率预热进行训练模型,所述学习率预热为10个EPOCH迭代次数,初始学习率设定为0,预热到学习率为0.01;S2、接收数据:接收样本数据,所述样本数据为待测甲型流感病毒的HA基因序列数据和NA基因序列数据;S3、输入数据:将所述样本数据输入甲型流感病毒分型模型;S4、输出结果:通过所述甲型流感病毒分型模型得到待测甲型流感病毒的H亚型和N亚型。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 北京化工大学 甲型流感病毒分型的计算机装置、方法和计算机可读存储介质

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