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申请/专利权人：武汉百沃克生物技术有限公司
摘要：本发明涉及一种高通量引物特异性筛查方法及应用，包括：基于短序列比对模式将目标物种的各个引物序列与所述目标物种对应的基因组序列进行比对，得到第一比对结果，第一比对结果包括各个引物序列在基因组序列中的位置；对各个引物序列汇整，得到由正向引物序列和反向引物序列组合成的引物对；基于探针比对工具，将第二引物序列文件中各个引物对作为序列探针，分别将各个引物对与基因组序列进行比对，得到第二比对结果,第二比对结果包括每个引物对的引物对名称、基因名称、正向引物的起始位置和反向引物的终止位置；基于第二比对结果对第一比对结果进行修正，得到至少一个引物对的特异性结果。本申请具有实现对高通量的引物进行特异分析的效果。
主权项：1.一种高通量引物特异性筛查方法，其特征在于，包括：获取所述目标物种的第一引物序列文件，所述第一引物序列文件包括多个引物序列，每个所述引物序列为单独的正向引物序列或反向引物序列；基于预设的短序列比对模式，将所述第一引物序列文件中的每个引物序列与所述目标物种对应的数据库中的基因组序列进行比对，得到所述目标物种的第一引物比对结果，所述第一比对结果至少包括每个引物序列在基因组序列中的比对位置；基于预设的汇整规则对各个所述引物序列进行汇整，得到引物列表，将所述引物列表作为第二引物序列文件，所述引物列表中包括由正向引物序列和反向引物序列组合成的引物对，一个所述引物对对应一个正向引物序列和一个反向引物序列；基于预设的探针比对工具，将第二引物序列文件中各个引物对作为序列探针，分别将各个引物对与所述数据库中的基因组序列进行比对，得到各个引物对的第二引物比对结果，所述第二引物比对结果至少包括每个引物对的引物对名称、基因名称、每个所述正向引物序列在所述基因组序列的起始位置和每个所述反向引物序列在所述基因组序列的终止位置；基于所述第二引物比对结果对所述第一引物比对结果进行修正，得到特异性唯一的至少一个比对的引物对的特异性结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 武汉百沃克生物技术有限公司 一种高通量引物特异性筛查方法及应用
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