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申请/专利权人：中国农业科学院蜜蜂研究所

摘要：本发明提供一种线粒体AT区域的全长基因组提取方法及装置，涉及计算机技术领域，该方法包括：获取目标对象的多个参考线粒体基因组；基于各参考线粒体基因组，提取线粒体集合；线粒体集合包括目标对象的多个线粒体测序基因组；基于第一预设AT区域序列基因组和第二预设AT区域序列基因组，确定各线粒体测序基因组分别对应的多个第一目标AT区域序列基因组和多个第二目标AT区域序列基因组；基于各第一目标AT区域序列基因组和各第二目标AT区域序列基因组，提取目标对象的线粒体AT区域的全长基因组，实现在不确定AT区长度的情况下准确地拼接出AT区的全长基因组。

主权项：1.一种线粒体AT区域的全长基因组提取方法，其特征在于，包括：获取目标对象的多个参考线粒体基因组；基于各所述参考线粒体基因组，提取线粒体集合；所述线粒体集合包括所述目标对象的多个线粒体测序基因组；基于第一预设AT区域序列基因组和第二预设AT区域序列基因组，确定各所述线粒体测序基因组分别对应的多个第一目标AT区域序列基因组和多个第二目标AT区域序列基因组；第一预设AT区域序列基因组和第二预设AT区域序列基因组均为AT区域上下游300bp的序列基因组，其中，第一预设AT区域序列基因组为300bp+AT区域序列，第二预设AT区域序列基因组为AT区域+300bp序列；第一目标AT区域序列基因组表示所有的第一AT区域序列基因组中与线粒体测序基因组匹配的AT区域序列基因组；第二目标AT区域序列基因组表示所有的第二AT区域序列基因组中与线粒体测序基因组匹配的AT区域序列基因组；基于各所述第一目标AT区域序列基因组和各所述第二目标AT区域序列基因组，提取所述目标对象的线粒体AT区域的全长基因组；所述基于第一预设AT区域序列基因组和第二预设AT区域序列基因组，确定各所述线粒体测序基因组分别对应的多个第一目标AT区域序列基因组和多个第二目标AT区域序列基因组，包括：针对每个所述线粒体测序基因组，基于第一预设AT区域序列基因组和第二预设AT区域序列基因组，对所述线粒体测序基因组进行合并，得到第一AT区域序列基因组和第二AT区域序列基因组；基于各所述第一AT区域序列基因组和各所述第二AT区域序列基因组，确定所有的第一AT区域序列基因组和所有的第二AT区域序列基因组；分别将各所述线粒体测序基因组与所述所有的第一AT区域序列基因组和所述所有的第二AT区域序列基因组进行比对，得到与各所述线粒体测序基因组匹配的多个第一匹配AT区域序列基因组和多个第二匹配AT区域序列基因组；基于各所述第一匹配AT区域序列基因组、各所述第二匹配AT区域序列基因组和各所述线粒体测序基因组，确定各所述线粒体测序基因组分别对应的多个第一目标AT区域序列基因组和多个第二目标AT区域序列基因组。

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