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基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库的构建方法 

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申请/专利权人:东南大学

摘要:本发明公开了基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库的构建方法(CBTi‑seq),本发明对Tn5转座子ME核心序列末端修饰编码序列标签,通过裸酶包埋制备编码Tn5转座酶,该转座酶能够在打断dsDNA的同时,将编码添加在片段末端,从而可以将多样本的内部片段收集至单管中,统一进行测序文库构建。并且不同编码Tn5转座酶可以根据实际需要,灵活组合使用,从而实现用更低的实验成本满足更高的通量需求,并且分开发出针对单个样本和多个样本的CBTi‑seq测序文库构建流程,通过与Smart‑seq2以及3’Targeting技术比对,证明CBTi‑seq技术的优越性。

主权项:1.基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库构建方法,其特征在于,包括以下步骤:1将Tn5转座子的ME核心序列与部分互补的Am或Bn序列通过退火结合得到产物,再通过Tn5裸酶包埋制备编码Tn5转座酶;2将样本裂解后捕获得到mRNA,然后进行逆转录和PCR扩增得到RT-PCR产物,加入步骤1得到的编码Tn5转座酶进行打断,反应结束后,加入文库扩增反应体系进行文库PCR扩增,加入磁珠进行纯化即得。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 东南大学 基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库的构建方法

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