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申请/专利权人：中国科学院天津工业生物技术研究所;天工生物科技(天津)有限公司
摘要：本发明涉及一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具,包括数据预处理单元解析用户上传的Excel文件，确定质粒文件名及目标基因和抗性基因的序列和位置；单点突变引物设计单元使用Primer3软件生成PCR引物和突变质粒文件；双点突变引物设计单元根据突变间距处理三种双点突变引物设计情况；测序验证引物设计单元生成测序所需引物；重组质粒图谱单元通过Bio工具包重组成新的质粒文件；数据检测收集单元检测并收集引物设计和质粒改造数据生成检测报告。有益效果：通过使用Primer3软件及BioPython工具包，自动解析用户序列数据设计PCR引物，并生成包含引物的突变质粒文件以及自动重组新的质粒文件。
主权项：1.一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具，其特征在于：包括：数据预处理单元1，所述数据预处理单元1读取并解析用户上传的Excel文件，去重并分组得到质粒文件名，判断每个样本的突变类型和质粒文件是否符合要求，并解析质粒文件确定目标基因和抗性基因的序列和位置；单点突变引物设计单元2，所述单点突变引物设计单元2使用Primer3软件包，根据输入的模板序列和用户设置的设计参数生成PCR引物，生成包含引物的突变质粒文件；双点突变引物设计单元3，所述双点突变引物设计单元3用于处理双点突变的引物设计，根据突变间距分为三种双点突变引物设计情况；测序验证引物设计单元4，所述测序验证引物设计单元4用于根据设计的突变和质粒序列生成测序所需的引物；重组质粒图谱单元5，所述重组质粒图谱单元5基于引物设计结果和PCR产物序列，通过Bio工具包将突变后的新基因和引物重组成新的质粒文件；数据检测收集单元6，所述数据检测收集单元6用于检测引物设计和质粒改造过程中产生的数据，收集成功和失败的设计结果，保存错误信息，并生成详细的检测报告。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院天津工业生物技术研究所 天工生物科技(天津)有限公司 一种面向质粒点突变改造引物设计的自动化在线工具
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