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一种松材线虫RPA-Exo检测的引物探针组合、检测方法及应用 

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申请/专利权人:中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心)

摘要:本发明公开了一种松材线虫RPA‑Exo检测的引物探针组合、检测方法及应用,属于生物检测技术领域。本发明以基因Syg2作为靶标进行引物和探针的设计,从6对引物中筛选出了扩增效果最佳的1组引物,并对反应温度进行了优化,建立了以syg2基因为靶标的松材线虫RPA‑Exo快速检测方法。该方法具有良好的特异性和敏感性,最低检测限为1pg10‑3ng;在39℃条件下等温扩增20min即可完成对松材线虫的检测。以Chelex‑100核酸快速提取方法从12份感病松木样本中提取的DNA,并采用上述筛选的最佳引物探针组合进行RPA‑Exo扩增,只要40min左右,准确率高,具有一定的野外即时检测应用潜力。

主权项:1.一种用于松材线虫RPA-Exo检测的引物探针组合,其特征在于,包括上游引物S1F、下游引物S1R和探针RPA-exo-P,所述上游引物S1F的序列如SEQIDNO.1所示,所述下游引物S1R的序列如SEQIDNO.2所示,所述探针RPA-exo-P的结构为核苷酸片段1-四氢呋喃残基-核苷酸片段2,其中核苷酸片段1的核苷酸序列为SEQIDNO.13,核苷酸片段2的核苷酸序列为SEQIDNO.14,SEQIDNO.13的第30位核苷酸T标记荧光基团,SEQIDNO.14的第3位核苷酸A标记淬灭基团,3’端进行阻断修饰。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心) 一种松材线虫RPA-Exo检测的引物探针组合、检测方法及应用

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