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申请/专利权人:瓯江实验室
摘要:本发明公开了基于柯林斯菌和中央静脉肝细胞筛选降胆固醇药物的方法、系统及存储介质,本发明首次发现中央静脉肝细胞是调节柯林斯菌和高胆固醇血症之间相互作用的关键介质,本发明为降胆固醇新药的研发提供了一种高效、准确、快速的筛选方法,在降胆固醇新药筛选方面具有非常广阔的应用前景。
主权项:1.一种基于柯林斯菌和中央静脉肝细胞筛选降胆固醇药物的方法,其特征在于,所述方法包括:获取柯林斯菌处理后的中央静脉肝细胞的单细胞转录组测序数据;获取待测药物和柯林斯菌同时处理后的中央静脉肝细胞的单细胞转录组测序数据;从所述柯林斯菌处理后的中央静脉肝细胞的单细胞转录组测序数据中提取出柯林斯菌处理后的中央静脉肝细胞中与胆固醇代谢通路相关的基因表达;从所述待测药物和柯林斯菌同时处理后的中央静脉肝细胞的单细胞转录组测序数据中提取出待测药物和柯林斯菌同时处理后的中央静脉肝细胞中与胆固醇代谢通路相关的基因表达;基于柯林斯菌处理后的中央静脉肝细胞中与胆固醇代谢通路相关的基因表达结果和待测药物和柯林斯菌同时处理后的中央静脉肝细胞中与胆固醇代谢通路相关的基因表达结果判断待测药物是否为降胆固醇药物;所述判断待测药物是否为降胆固醇药物包括:若待测药物能够逆转单独的柯林斯菌处理后的中央静脉肝细胞中与胆固醇代谢通路相关的基因表达,则该待测药物为降胆固醇药物;所述胆固醇代谢通路相关的基因为编码胆固醇7α-羟化酶的基因CYP7A1、编码3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶的基因HMGCR、编码法尼醇X受体的基因NR1H4。
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百度查询: 瓯江实验室 基于柯林斯菌和中央静脉肝细胞筛选降胆固醇药物的方法、系统及设备
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