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具有区段保留的蛋白质设计 

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申请/专利权人:基因泰克公司

摘要:本文提供了一种用于区段保留蛋白质设计的方法,所述方法包括在具有第一残基序列的蛋白质结构内确定一个或多个固定区段和可调整区段。所述蛋白质结构可以被标识为具有期望的特性。蛋白质设计计算模型可以用于生成第二残基序列,所述第二残基序列包含对第一可调整区段的破坏和长度变化中的至少一者。所述蛋白质设计计算模型可以进一步用于生成具有所述第二残基序列的经修饰的蛋白质结构。形成所述经修饰的蛋白质结构的所述第二残基序列包括存在于所述第一残基序列中的所述固定区段。可以进行结构和或功能分析以确定所述经修饰的蛋白质结构是否也表现出与所述蛋白质结构相同的期望的特性。还提供了相关系统和计算机程序产品。

主权项:1.一种系统,其包括:至少一个数据处理器;以及存储指令的至少一个存储器,所述指令当由所述至少一个数据处理器执行时引起包括以下的操作:在具有第一残基序列的蛋白质结构内确定第一固定区段和第一可调整区段;标识与所述蛋白质结构相关联的期望的特性;使用蛋白质设计计算模型来生成第二残基序列,所述第二残基序列包含对所述第一可调整区段的破坏和长度变化中的至少一者;以及使用所述蛋白质设计计算模型来生成具有所述第二残基序列的经修饰的蛋白质结构。

全文数据:

权利要求:

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