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一种用于鉴定茶果樟及其他樟属植物的方法 

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申请/专利权人:中国科学院昆明植物研究所

摘要:本申请是关于一种用于鉴定茶果樟及其他樟属植物的方法,包括:采集茶果樟及其近缘种的基因组浅层测序数据,构建樟属物种的基因组浅层测序数据集;对未知植物物种进行基因组浅层测序,得到测序数据;对测序数据进行数据优化得到目标数据;基于样品基因组和目标数据构建物种鉴定树,并基于物种鉴定树确定未知植物物种的茶果樟物种鉴定。本方法在低测序深度下具有较高的分辨率,显著提高物种鉴定的准确性和效率,方法采用了免比对和免组装的处理策略,绕开基因组组装步骤,有效避免在组装过程中的人为干扰,保证鉴定结果的客观性和准确性,实现对茶果樟及其他樟属植物的快速、可靠鉴定,为植物分子生物技术领域提供了一种新的解决方案流程化的处理方法。

主权项:1.一种用于鉴定茶果樟及其他樟属植物的方法,其特征在于,包括:采集茶果樟及其近缘种的基因组浅层测序数据,构建樟属物种的基因组合集,所述基因组合集内包含多个样品基因组;对目标未知植物物种进行基因组浅层测序,得到测序数据,其中,所述测序数据包括单端测序数据或双端测序数据;对所述测序数据进行数据优化得到目标数据;基于所述样品基因组和所述目标数据构建物种鉴定树,并基于所述物种鉴定树确定所述目标未知植物物种的茶果樟物种鉴定。

全文数据:

权利要求:

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