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申请/专利权人:天津商业大学
摘要:本发明涉及一种基于融合多源特征的植物外源性微肽预测方法,其技术特点是:从公共数据库中搜集植物微肽数据并进行预处理;构建用于模型训练和测试的数据集;基于多粒度扫描,分别抽取多源特征进行特征降维处理;将降维后的多源特征输入到异构机器学习模型中,获取分类向量,得到变换后的多源特征;通过级联森林对多源特征进行深层表征,获取多源级联特征;使用级联特征训练多个机器学习模型,基于集成学习stacking策略融合模型,实现对多源特征的融合并对植物外源性微肽进行预测。本发明设计合理,实现了基于融合多源特征的植物外源性微肽的预测功能,能够准确和有效预测植物miPEPs。
主权项:1.一种基于融合多源特征的植物外源性微肽预测方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤1、从公共数据库中搜集植物微肽数据,并对获取的数据进行预处理,创建知识库对数据进行筛选,提高数据可信度;步骤2、对步骤1得到的数据进行整合,构建用于模型训练和测试的数据集,对极端不平衡数据集基于下采样进行拆分,以获得若干个平衡的子数据集;步骤3、基于深度森林的多粒度扫描结构,分别抽取多源特征,通过EFISS-ES特征选择方法进行特征降维处理;将降维后的多源特征输入到异构机器学习模型中,获取分类向量,得到变换后的多源特征;步骤4、基于深度森林的级联森林结构,对多源特征进行深层表征,获取多源级联特征;步骤5、使用级联特征训练多个机器学习模型,基于集成学习stacking策略融合多个机器学习模型,对多源特征进行融合并对植物外源性微肽进行预测。
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权利要求:
百度查询: 天津商业大学 基于融合多源特征的植物外源性微肽预测方法
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