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申请/专利权人：江苏运动健康研究院
摘要：本发明涉及生物医药技术领域，特别是涉及一种用于乳腺癌新辅助治疗疗效动态评估的标志物筛选方法及标志物组合，公开了用于乳腺癌新辅助治疗疗效评估的标志物组合，包括95个MRI图像特征和14个甲基化序列特征，更加全面了解肿瘤NAT后进展情况，给予更精准更早期疗效评估，辅助临床医生制定个性化的治疗计划，可尽早促进新的临床试验的开展，避免不必要的化疗毒副作用和手术延迟，能够减轻患者和医保负担。本发明构建疗效评估模型，以解决目前简单的MRI检查手段用于新辅治疗疗效评价过程中存在的不准确、效率低等问题。同时，运用目前的标志物组合，可动态监测并评估新辅助治疗过程中各个阶段的用药价值。
主权项：1.一种用于乳腺癌新辅助治疗疗效动态评估的标志物筛选方法，其特征在于，包括以下具体步骤：S1、采集数据；S11、采集接受新辅助治疗的患者MRI图像的时序；S12、采集新辅助治疗后实现pCR的乳腺癌患者以及未实现pCR的乳腺癌患者穿刺前的血液样本；S2、将S11中的患者MRI图像的时序转化为医学数字成像和通信标准DICOM格式；S3、人工手动勾画感兴趣区ROI；S4、采用U-Net分割网络，对感兴趣区ROI进行图像分割，训练出自动分割模型；S5、使用Python从开源的PyRadiomics工具中提取自动分割模型分割后的感兴趣区特征；S6、对采集后的血液进行cfDNA测序转化；S7、利用fastp软件对数据的碱基质量、GC含量、adaptor含量等进行质控，切除或者删除低质量碱基；S8、利用Bismark软件把两组测序进行比对；分析hyper-DMR与hypo-DMR在各基因区域的分布比例，并与随机序列的分布比例进行比较，得到两者在各区域的富集倍数；S9、对于两组DMR，分别找到基因组上全部受到DMR影响的基因。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 江苏运动健康研究院 一种用于乳腺癌新辅助治疗疗效动态评估的标志物筛选方法及标志物组合
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