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申请/专利权人：南京大学
摘要：本申请提供了一种细胞特异性转录暂停位点的分析方法、系统及存储介质，通过综合数据库以及综合数据整理分析后，可以深入了解各种细胞类型和生理条件下暂停现象的多样性及其功能意义。本申请可以全面了解不同细胞类型和生理条件下转录暂停的多样性和分布特征；可以深入分析转录暂停与基因表达调控的关系及其潜在功能意义；可以探究转录暂停在细胞过程中的作用,如分化、发育等；为相关疾病的诊断和治疗提供新的生物标志物和靶点。
主权项：1.一种细胞特异性转录暂停位点的分析方法，其特征在于，包括：收集来自人类、小鼠和果蝇三个物种的不同细胞系的N份新生RNA测序数据；收集与转录暂停相关的调控因子的ChIP-seq峰值数据；根据所述新生RNA测序数据反映的转录暂停水平，确定转录活性的暂停指数；根据所述N份新生RNA测序数据反映的转录延伸水平，确定转录活性的延伸指数；根据所述N份新生RNA测序数据反映的RNA聚合酶延伸速度数据，确定转录活性的延伸速度；基于所述新生RNA测序数据识别显著的转录暂停位点，并标注所述转录暂停位点的已知信息，所述已知信息包括：暂停位点在转录起始位点附近的邻近暂停位点和基因组范围内的全局暂停位点；确定所述转录暂停位点的序列和结构特征；并根据所述转录暂停位点得到转录暂停调控因子分析、转录活性差异分析以及功能基因组学分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 南京大学 细胞特异性转录暂停位点的分析方法、系统及存储介质
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