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最优基因子集选取鉴别三阴性乳腺癌的分子亚型方法 

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申请/专利权人:天津大学合肥创新发展研究院

摘要:本发明公开了一种最优基因子集选取鉴别三阴性乳腺癌的分子亚型方法,本发明以现有的TNBC研究框架为基础,提出的算法将GeneRank与嵌入TOM的自动编码器AE结合了起来,通过利用网络训练过程中的神经元连接权重,将基因的重要性与神经元权重之和的绝对值联系了起来,使用遗传算法对生物进化的过程进行仿真处理,选出最优的TNBC亚型子集,并利用交叉验证的方法对结果进行验证。实验结果表明,本发明提出的方法更加精准的提取基因子集,精准地鉴别三阴性乳腺癌的分子亚型。

主权项:1.一种最优基因子集选取鉴别三阴性乳腺癌的分子亚型方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1,构建数据集;步骤2,构建基因的加权共表达网络,筛选出候补基因集;步骤3,计算基因的GeneRank排名;步骤4,嵌入TOM矩阵的AE计算的基因重要性得分;步骤5,计算基因特征重要性的得分排名;步骤6,采用遗传算法来确定最终基因候选集。

全文数据:

权利要求:

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