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申请/专利权人:首都医科大学附属北京世纪坛医院;上海科技大学
摘要:本发明公开了一种利用多重免疫荧光对HE病理图像进行自动细胞标注的方法,包括以下步骤:S1、数据获取及预处理;S2图像配准;S3、基于规则的细胞类型标注。本发明的方法能够将同一组织的多重免疫荧光图像与HE图像进行配准,利用多重免疫荧光自动对HE图像进行细胞标注。本发明的方法可以自动产生大量的细胞标注,无需人工参与,并且可以标记的细胞类型也十分广泛。
主权项:1.一种利用多重免疫荧光对HE病理图像进行自动细胞标注的方法,其特征在于:包括以下步骤:S1、数据获取及预处理收集肿瘤组织对应的HE及多重免疫荧光染色图像,并进行预处理,包括降采样至相同像素尺寸、去除伪影、灰度值归一化,得到至少一对低分辨率的HE和免疫荧光图像对和至少一对高分辨率的图像对;S2、图像配准对S1中预处理后得到的HE和免疫荧光图像对,先通过低分辨率的HE和免疫荧光图像对进行全局配准,再通过高分辨率的HE和免疫荧光图像对进行局部配准,使两张图像达到细胞级的精细匹配;S3、基于规则的细胞类型标注计算HE上的细胞核在免疫荧光图像上各通道对应的平均灰度值,并基于规则对细胞类型进行多标签的标注。
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