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一种药物分子性质预测分类方法及系统 

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申请/专利权人:山东师范大学

摘要:本发明公开一种药物分子性质预测分类方法及系统,包括:获取待测药物的分子图;对分子图分别进行分子描述符和分子指纹的特征提取,得到分子定向传递信息和摩根分子指纹信息;对分子定向传递信息和摩根分子指纹信息进行特征融合;根据融合特征采用训练后的分类模型得到药物的分子性质预测结果。提出一种针对不同规格的分子描述符和分子指纹信息的分类方法,采用两种不同规格的卷积神经网络分别对分子描述符和分子指纹进行特征提取;采用分子定向传递信息和摩根分子指纹信息的融合特征,更精确地识别药物分子性质,从而实现精确分类。

主权项:1.一种药物分子性质预测分类方法,其特征在于,包括:获取待测药物的分子图;对分子图分别进行分子描述符和分子指纹的特征提取,得到分子定向传递信息和摩根分子指纹信息;其中,通过定向信息传递神经网络对分子描述符进行特征提取,获取的分子定向传递信息即作为分子描述符,获取分子定向传递信息的过程包括:初始化原子隐藏状态;根据分子图的信息传递,对原子隐藏状态和原子信息进行更新;根据更新后的原子信息和原子隐藏状态,对原子隐藏状态求和得到分子定向传递信息;获取分子指纹的过程包括:对分子图中的原子进行初始化,为每个重原子分配整数标识符;以每个重原子为中心,在重原子圈中进行合并,直到达到指定半径,生成特征列表,得到分子指纹;得到摩根分子指纹信息具体包括:获取分子指纹,将分子指纹的一维信息转化为二维信息,从而进行特征提取得到摩根分子指纹信息;对分子定向传递信息和摩根分子指纹信息进行特征融合,具体的:在两种维度的特征提取网络之后加入融合层,两种网络通过不同维度的网络分别提取不一样的特征信息,即分子定向传递信息和摩根分子指纹信息,在融合层中对这些信息进行积累并融合;根据融合特征采用训练后的分类模型得到药物的分子性质预测结果,具体的:采用支持向量机对分类层中采集到的特征进行分类。

全文数据:

权利要求:

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