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申请/专利权人:孔确(成都)科技有限公司
摘要:本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种用于检测粪便DNA的试剂盒和基于其的鸟类食性分析方法,包括:S101提取鸟类粪便样本中的基因组DNA;S102获得PCR扩增产物;S103获得测序数据;S104获得经第一质量控制的测序数据;S105获得经第二质量控制的测序数据;S106构建操作性分类单元或扩增子序列变体;S107获得所述鸟类的食性信息。本发明的物种检出率、物种分类覆盖率且分辨率均较高,能够有效区分不同的物种类群的各个物种并全面地分析食物组成分类学跨度较大的鸟类的食性。
主权项:1.一种用于检测粪便DNA的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:用于扩增叶绿体rbcL基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:1所示的第一正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:2所示的第一反向引物;用于扩增叶绿体trnLP6基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:3所示的第二正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:4所示的第二反向引物;用于扩增线粒体16S基因的第一引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:5所示的第三正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:6所示的第三反向引物;用于扩增线粒体12SV5基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:7所示的第四正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:8所示的第四反向引物;用于扩增线粒体Cytb基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:9所示的第五正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:10所示的第五反向引物;用于扩增线粒体COI基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:11所示的第六正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:12的第六反向引物;用于扩增线粒体16S基因的第二引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:13的第七正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:14所示的第七反向引物;用于扩增线粒体12S基因的引物对,其包括核苷酸序列如SEQIDNO:15所示的第八正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO:16所示的第八反向引物。
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