恭喜苏州大学祝坤获国家专利权
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龙图腾网恭喜苏州大学申请的专利基于迭代k-mer分解的基因组组装方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119360966B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411915277.7,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权基于迭代k-mer分解的基因组组装方法及系统是由祝坤;孙玉娥;杜扬;黄河设计研发完成,并于2024-12-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于迭代k-mer分解的基因组组装方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及计算机技术领域,具体提供了基于迭代k‑mer分解的基因组组装方法及系统,方法包括根据序列长度处理序列片段集合,得到频数集合;首个序列长度为输入的序列片段集合的最大序列长度;根据预设频数阈值划分频数集合,得到高频集合和低频集合;判断预设长度阈值和序列长度大小;若预设长度阈值不大于序列长度,将低频集合作为新序列片段集合,对序列长度进行减值操作,根据减值操作得到的序列长度,处理新序列片段集合,得到新序列片段集合对应的新高频集合和低频集合;若预设长度阈值大于序列长度,根据得到的多个高频集合构建德布鲁因图,根据德布鲁因图输出组装序列集合。本发明有效降低计算负担、提高组装速度和组装质量。
本发明授权基于迭代k-mer分解的基因组组装方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于迭代k-mer分解的基因组组装方法,其特征在于,包括:根据序列长度处理序列片段集合,得到频数集合;其中,包括根据所述序列长度,提取所述序列片段集合中的每个序列片段,得到每个所述序列片段所对应的连续核苷酸序列和连续核苷酸序列个数;建立所述连续核苷酸序列和所述连续核苷酸序列个数之间的映射关系,得到所述频数集合;首个所述序列长度为输入的所述序列片段集合的最大序列长度;根据预设频数阈值,划分所述频数集合,得到高频集合和低频集合;判断预设长度阈值和所述序列长度的大小;若所述预设长度阈值不大于所述序列长度,则将所述低频集合作为新的所述序列片段集合,对所述序列长度进行减值操作,根据减值操作得到的所述序列长度,处理新的所述序列片段集合,以得到新的所述序列片段集合所对应的新的高频集合和低频集合;若所述预设长度阈值大于所述序列长度,则根据得到的多个所述高频集合构建德布鲁因图,并根据所述德布鲁因图输出组装序列集合。
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