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申请/专利权人：贵州工程应用技术学院
摘要：本发明公开了一种检测山羊OPN4基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR，以贵州白山羊、贵州黑山羊的基因组DNA为模板，扩增山羊OPN4基因的CNV标记位点，再以扩增的山羊MC1R基因部分片段作为内参，然后通过2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明可在DNA水平上检测与山羊地方品种生长性状密切相关的CNV标记，加快山羊良种繁育速度，并且该方法简单、快速，便于推广应用。
主权项：1.一种检测山羊OPN4基因CNV标记的方法在山羊分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述检测山羊OPN4基因CNV标记的方法包括以下步骤：以山羊基因组DNA为模板，分别通过实时定量PCR扩增OPN4基因的CNV区域部分片段及作为参考的MC1R基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定山羊OPN4基因的拷贝数变异类型；所述的CNV区域定位于山羊OPN4基因参考基因组序列NC_030835.1的4401501位到4403500位；所述的拷贝数变异类型是根据2*2-∆∆Ct将定量结果分为的三类：多拷贝型，2*2-∆∆Ct2；缺失型，2*2-∆∆Ct2；正常型，2*2-∆∆Ct=2；所述的OPN4基因的CNV区域部分片段的扩增引物对为：上游引物F：5’-CGTGATACCAGGCTCCAGA-3’下游引物R：5’-ACGGCGAGGTTGATAATGA-3’；所述的MC1R基因的部分片段的扩增引物对为：上游引物F：5’-CTCGTTGGCCTCTTCATAGC-3’下游引物R：5’-GAAGTTCTTGAAGATGCAGCC-3’；所述山羊为贵州白山羊或贵州黑山羊；具有缺失型拷贝数变异类型的贵州黑山羊个体的体长较短，具有正常型拷贝数变异类型的贵州白山羊个体体重较大。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 贵州工程应用技术学院 一种检测山羊OPN4基因CNV标记的方法及其应用
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