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一种海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的特异性分子鉴别方法 

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申请/专利权人:江苏省淡水水产研究所

摘要:本发明涉及一种海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的特异性分子鉴别方法,步骤包括:1分别提取海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢基因组DNA;2PCR扩增海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的线粒体控制区,得到目的片段的PCR产物;3扩增产物纯化后,直接测序,海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢扩增产物序列比对,序列的第253‑258位点碱基为GGGGGG的是海丰沙塘鳢,序列的第253‑258位点碱基为CCCCCC的则是河川沙塘鳢。本发明能够快速、简便、准确、有效地鉴别海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢,结果稳定性好,重复率高,这种鉴定方法将在水产养殖和资源调查中发挥重要作用。

主权项:1.一种海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的特异性分子鉴别方法,其特征在于:包含以下步骤,1分别提取待鉴定的海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢基因组DNA;2以提取的基因组DNA为模板,PCR扩增海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的线粒体控制区,得到目的片段的PCR产物;所述的PCR扩增海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢的线粒体控制区,其使用的上游引物如序列SEQIDNO.1所示,下游引物如序列SEQIDNO.2所示;所述的PCR反应体系为50μL:50ngμL的模板DNA1μL,PCR缓冲液5μL,dNTP混合液4μL,每种dNTP0.1mmolL,10μmolL的上、下游引物各1μL,2μL2IU的Taq酶;双蒸水36μL;所述的PCR缓冲液由10mmolLTris-HCl,pH9.0,0.5mmolLKCl,30mmolLMgCl2,0.01%明胶组成;PCR扩增反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性45s,53℃退火1min,72℃延伸1min,经30个循环后再72℃延伸10min;3扩增产物纯化后,直接测序,进行海丰沙塘鳢和河川沙塘鳢扩增产物序列比对,序列的第253-258位点碱基为GGGGGG的是海丰沙塘鳢,序列的第253-258位点碱基为CCCCCC的是河川沙塘鳢。

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