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申请/专利权人：杭州灵思智康科技有限公司
摘要：本发明公开了一种使用AptaGenDiff生成模型生成Aptamer序列的方法，包括以下步骤：针对公开数据集中SELEX筛选得到的适配体序列进行去重处理；将原始适配体序列进行编码；利用AptaGenDiff，使用潜在空间的分布作为条件参与扩散模型的去噪过程，进而生成与原始序列具有相近亲和力的适配体序列；利用生成的可能具有亲和力的序列作为新的适配体序列，用于补充SELEX初始文库。通过结合扩散模型和变分自动编码器，模型能够以某一蛋白的部分具有亲和力的适配体序列作为数据进行模型训练，不断采样获取可能具有高亲和力的新序列，用于补充SELEX初始文库。
主权项：1.一种使用AptaGenDiff生成模型生成Aptamer序列的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、针对公开数据集中SELEX筛选得到的Aptamer序列进行去重处理；S2、将原始Aptamer序列进行one-hot编码；S3、利用深度学习模型AptaGenDiff，包括编码器、扩散模型的加噪过程、重参数化技巧、扩散模型的去噪过程，将序列映射到潜在空间的分布，并进行训练；S4、在训练过程中，使用潜在空间的分布作为条件参与扩散模型的去噪过程，进而生成与原始序列具有相近亲和力的Aptamer序列；S5、利用生成的可能具有亲和力的序列作为新的Aptamer序列补充SELEX初始文库。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州灵思智康科技有限公司 一种使用AptaGenDiff生成模型生成Aptamer序列的方法
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