申请/专利权人：中国农业科学院农业基因组研究所;中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

申请日：2024-03-21

公开（公告）日：2024-05-31

公开（公告）号：CN118109630A

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04

优先权：

专利状态码：在审-实质审查的生效

法律状态：2024.06.18#实质审查的生效;2024.05.31#公开

摘要：本发明公开了水稻穗颈小维管束数基因LOC_Os07g49460的功能分子标记方法及其应用，涉及水稻分子育种技术领域，其技术方案要点是：SNP27810标记位于水稻第7染色体29627810的物理位置rs7_29627810，其碱基为A‑G的多态位点，当该位点为AA时，水稻穗颈小维管束数较多，当该位点为GG时，水稻穗颈小维管束数较少。本发明利用4.8M高密度的SNP基因型数据与水稻穗颈小维管束数表型数据进行全基因组关联分析GWAS定位到影响穗颈小维管束数的QTLqSVN7，且鉴定了调控水稻穗颈小维管束数的候选基因LOC_Os07g49460并通过构建转基因材料验证了基因功能，利用基于候选基因的关联分析鉴定了LOC_Os07g49460基因上与表型显著关联的变异位点，基于该变异位点开发了相应的功能分子标记，该功能分子标记方法可用于水稻分子标记辅助选择育种中。

主权项：1.水稻穗颈小维管束数基因LOC_Os07g49460的功能分子标记方法，其特征是：所述功能分子标记命名为SNP27810，所述标记位于水稻第7染色体29627810物理位置rs7_29627810，具体核苷酸序列为：AGATCGCTAATGGCACCATCAACAAAAGTG[AG]ACCTGGAGGTGGCAATGGAAGTGGAAGCGG，其中rs7_29627810的物理位置具有AG多态性；具体而言：当该位点为AA时，为穗颈小维管束数的优异基因型，其核苷酸序列命名为SEQIDNO.1，SEQIDNO.1具体为：AGATCGCTAATGGCACCATCAACAAAAGTGAACCTGGAGGTGGCAATGGAAGTGGAAGCGG；当该位点为GG时，为穗颈小维管束数的劣势基因型，其核苷酸序列命名为SEQIDNO.2，SEQIDNO.2具体为：AGATCGCTAATGGCACCATCAACAAAAGTGGACCTGGAGGTGGCAATGGAAGTGGAAGCGG。

全文数据：

权利要求：

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