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申请/专利权人：武汉市农业科学院
申请日：2024-01-11
公开（公告）日：2024-06-11
公开（公告）号：CN117821650B
主分类号：C12Q1/6895
分类号：C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11
优先权：
专利状态码：有效-授权
法律状态：2024.06.11#授权;2024.04.23#实质审查的生效;2024.04.05#公开
摘要：本发明属于分子育种技术领域，具体涉及一种芋全基因组SNP‑Panel及其应用。本发明要解决的技术问题是开发一种覆盖芋全基因组的通量高、成本低的分子标记检测体系。本发明的技术方案是一种芋全基因组SNP‑Panel，包括695个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物。利用所述SNP‑Panel通过一次扩增反应，可实现695个SNP位点的同时检测，具有很好的应用前景。
主权项：1.芋全基因组SNP-Panel在建立芋DNA指纹数据库和或遗传多样性分析中的应用，其特征在于：包括695个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物，所述695个SNP位点信息及扩增引物序列如表1所示；所述建立芋DNA指纹数据库的步骤如下：利用上述695个SNP位点的引物对芋的基因组DNA进行混合PCR扩增，扩增产物经测序、分型，获得芋在所述695个SNP位点上的的基因型数据，即构成芋DNA指纹数据库；所述遗传多样性分析的步骤如下：在获得芋DNA指纹数据库后，对待分析样本建立聚类树状图，计算遗传多样性参数，即可得到芋的遗传多样性分析结果；表1695个SNP位点信息及扩增引物序列 表1中的染色体上的碱基位置是以公开的芋基因组序列Taro_JAAS_v1.0作为参照。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 武汉市农业科学院 一种芋全基因组SNP-Panel及其应用
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