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申请/专利权人：上海数因信科智能科技有限公司
申请日：2024-03-28
公开（公告）日：2024-06-14
公开（公告）号：CN118197395A
主分类号：G16B15/20
分类号：G16B15/20;G16B20/00;G16B30/00;G16B40/20;G06F18/2431;G06N3/042;G06N3/084
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.14#公开
摘要：一种基于图神经网络的蛋白序列设计方法，通过将蛋白或蛋白复合物的骨架信息表征为无向图，然后构造并训练图神经网络，最后通过训练后的图神经网络在线预测各位点的氨基酸序列类别。本发明能够针对任意给定的一个蛋白或蛋白复合物的三维结构的骨架信息，生成对应能够折叠成该骨架的氨基酸序列，提高设计具备功能的蛋白序列的效率。
主权项：1.一种基于图神经网络的蛋白序列设计方法，其特征在于，通过将蛋白或蛋白复合物的骨架信息表征为无向图，然后构造并训练图神经网络，最后通过训练后的图神经网络在线预测各位点的氨基酸序列类别；所述的表征为无向图是指：根据蛋白或蛋白复合物的三维结构的骨架信息中的氨基酸为节点，以氨基酸Ca原子之间的欧氏距离为度量的K-近邻kNN网络，依次对网络的节点以及边进行特征提取和计算得到无向图，图中的节点和边均赋予其特征向量。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海数因信科智能科技有限公司 基于图神经网络的蛋白序列设计方法
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