申请/专利权人:因美纳有限公司
申请日:2019-10-29
公开(公告)日:2024-06-14
公开(公告)号:CN118197424A
主分类号:G16B30/20
分类号:G16B30/20;G16B30/10;G16B15/10;G16B50/00;G06F16/22;G06F16/2458
优先权:["20181031 US 62/753786"]
专利状态码:在审-公开
法律状态:2024.06.14#公开
摘要:本申请公开了用于折叠测序读值和鉴定相似测序读值的系统和方法。在一个实例中,方法包括从每个核苷酸测序读值的第一标识符序列产生多个第一标识符子序列,并通过对所述多个第一标识符子序列应用哈希处理来产生核苷酸测序读值的第一名签。该方法可以包括基于第一名签将核苷酸测序读值分配到第一数据结构的第一具体箱,并在一个或多个核苷酸测序读值分配的情况下,确定第一数据结构的每个第一具体箱的核苷酸序列。
主权项:1.用于从核苷酸测序读值确定核苷酸序列的系统,所述系统包括:非暂时性存储器,所述非暂时性存储器被配置为存储可执行指令和第一哈希数据结构,所述第一哈希数据结构用于将核苷酸测序读值存储在多个箱中;和由所述可执行指令编程以执行包括以下步骤的方法的硬件处理器:接收多个第一核苷酸测序读值;对于每个第一核苷酸测序读值:从所述第一核苷酸测序读值的第一标识符序列生成多个第一标识符子序列;通过对所述多个第一标识符子序列应用哈希处理来生成所述第一核苷酸测序读值的第一名签;和基于所述第一名签,将所述第一核苷酸测序读值分配到第一哈希数据结构的至少一个第一具体箱;以及在一个或多个第一核苷酸测序读值被分配的情况下,确定第一哈希数据结构的每个第一具体箱的核苷酸序列。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 因美纳有限公司 用于测序读值的分组和折叠的系统和方法
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