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申请/专利权人：东南大学
申请日：2021-08-13
公开（公告）日：2024-06-14
公开（公告）号：CN113699215B
主分类号：C12Q1/6811
分类号：C12Q1/6811
优先权：
专利状态码：有效-授权
法律状态：2024.06.14#授权;2021.12.14#实质审查的生效;2021.11.26#公开
摘要：本发明公开了一种核酸适体筛选方法，包括：将待检验的核酸样品分为两组，第一组核酸样品在不含靶物质的条件下进行扩增，或不进行扩增，第二组一组核酸样品在含有靶物质的条件下进行扩增；对扩增后的两组核酸样品分别进行测序；测序完成后，比较两组核酸样品中核酸序列的覆盖深度差异，找出第二组中覆盖深度明显下降的核酸序列，筛选出候选核酸适体。该筛选方法能够更加简便、快捷、大批量地进行核酸适体的筛选，适用于从较长序列的核酸、多物种的基因组中筛选候选核酸适体。
主权项：1.一种核酸适体筛选方法，其特征在于：包括如下步骤：（1）将待检验的核酸样品分为两组，第一组核酸样品在不含靶物质的条件下进行扩增，或不进行扩增，第二组核酸样品在含有靶物质的条件下进行扩增；（2）对扩增后的两组核酸样品分别进行测序；（3）测序完成后，比较两组核酸样品中核酸序列的覆盖深度差异，找出第二组中覆盖深度明显下降的核酸序列，筛选出候选核酸适体；所述步骤（3）中核酸序列的覆盖深度，是测序结果中比对到目标序列的碱基总数与目标序列区域大小的比值；所述步骤（3）中比较两组核酸样品中核酸序列的覆盖深度差异，是指对所述两组核酸样品各个核酸序列和碱基位置的覆盖深度分别进行统计，比较两组核酸样品中核酸序列的覆盖深度差异；所述步骤（3）中所述覆盖深度明显下降，是指在第二组中覆盖深度相较于第一组下降50%及以上，且这种下降持续超过10个碱基。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 东南大学 一种核酸适体筛选方法
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