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基于质谱数据的宏蛋白质组学分析方法及电子设备 

申请/专利权人:西湖大学

申请日:2022-08-05

公开(公告)日:2024-06-14

公开(公告)号:CN115267033B

主分类号:G01N30/72

分类号:G01N30/72;G01N30/88;G01N30/86

优先权:

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.06.14#授权;2022.11.18#实质审查的生效;2022.11.01#公开

摘要:本申请实施例公开了一种基于质谱数据的宏蛋白质组学分析方法及电子设备,该方法包括:从微生物蛋白质数据库中分别选取蛋白质数据,每次选取的蛋白质数据形成与每个第一质谱数据一一对应的第一数据集;在错误发现率符合第一阈值的情况下,分别从每个第一数据集中提取蛋白质数据形成第二数据集;在错误发现率符合第二阈值的情况下,基于每个第一质谱数据从第二数据集中选取蛋白质数据,并构建第一谱图库;对第一谱图库进行优化处理形成第二谱图库;基于第二谱图库和第二质谱数据,对第二样本中包含的肽段和相关联的蛋白质进行定性和定量分析,以获取分析结果。能够实现高深度、高可重复性、高准确性和高通量的宏蛋白质组学分析。

主权项:1.一种基于质谱数据的宏蛋白质组学分析方法,其特征在于,包括:通过与每个第一质谱数据匹配,从微生物蛋白质数据库中分别选取蛋白质数据,每次选取的蛋白质数据形成与每个所述第一质谱数据一一对应的第一数据集;其中,所述第一质谱数据为基于数据依赖性串联质谱法对第一样本进行质谱分析形成的质谱数据,所述第一样本来自目标对象群体中多个目标对象的肠道微生物肽段混合样本;所述蛋白质数据至少包括用于标识蛋白质的第一蛋白质序列;在错误发现率符合第一阈值的情况下,分别从每个第一数据集中提取蛋白质数据,并将所有第一数据集中所提取的蛋白质数据形成第二数据集;在错误发现率符合第二阈值的情况下,基于每个所述第一质谱数据从所述第二数据集中选取蛋白质数据,并基于所选取的蛋白质数据、第一肽序列、肽段的生化信息以及所述第一蛋白质序列和所述第一肽序列的关联关系构建第一谱图库;其中,所述第一肽序列和肽段的生化信息基于所述第一质谱数据获得,所述第一肽序列用于标识所述第一样本中的肽段;对所述第一谱图库进行优化处理,以简化所述第一蛋白质序列和所述第一肽序列的关联关系,形成第二谱图库;基于第二谱图库和第二质谱数据,对第二样本中包含的肽段和相关联的蛋白质进行定性和定量分析,以获取分析结果;其中,所述第二质谱数据为基于数据非依赖性串联质谱法对所述第二样本进行质谱分析形成的质谱数据,所述第二样本来自所述目标对象群体中单个目标对象的肠道微生物肽段样本;所述分析结果包括第二肽序列、所述第二肽序列的丰度信息、第二蛋白质序列和所述第二蛋白质序列的丰度信息;所述第二肽序列用于标识第二样本中的肽段,所述第二蛋白质序列用于标识与第二样本中肽段相关联的蛋白质。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 西湖大学 基于质谱数据的宏蛋白质组学分析方法及电子设备

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