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申请/专利权人：中国科学院华南植物园;广州佰数生物科技有限公司
申请日：2024-04-01
公开（公告）日：2024-06-18
公开（公告）号：CN118207294A
主分类号：C12Q1/6806
分类号：C12Q1/6806;G16B25/00;G16B45/00;C12Q1/6895;C12N15/11
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.18#公开
摘要：本发明公开了高重复序列大基因组物种的单染色体图谱构建的探针组制备方法、探针组序列和图谱构建方法，属于基因工程技术领域。探针序列为OMIX数据库https:ngdc.cncb.ac.cnomix的登录号为OMIX006067所包含的全部序列或其反向互补序列。本发明公开的探针组和方法具有高密度、长区间，达到信号清晰可视化的效果，可应用于植物染色体结构变异分析和种植资源的辅助挖掘。
主权项：1.一种高重复序列大基因组物种的染色体荧光标记探针组的设计方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：1根据参考基因组屏蔽去掉重复序列；2获得45bp单拷贝寡核苷酸序列库；3去除包含≥6个连续相同碱基重复的短片段，保留GC含量25～80％短序列；4保留dTm值大于10℃的短序列库；5将短序列库比对回目标区域，去除非目标区域探针片段获得探针组。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院华南植物园;广州佰数生物科技有限公司 用于高重复大基因组燕麦野生种单染色体图谱构建的探针和方法
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