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一种采用多段自注意力机制进行测序分析的方法 

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申请/专利权人:南京层云智能科技有限公司

摘要:本发明公开了一种采用多段自注意力机制进行测序分析的方法,涉及数据处理分析技术领域,步骤为:输入四组原始数据序列raw1、raw2、raw3、raw4;进行数据处理,得到输入序列raw_in;将序列raw_in进行标准化操作和位置编码;raw_in输入3个可学习的前馈神经网络W_q、W_k、W_v,得到矩阵Q、K、V;W_q、W_k、W_v的维度[4,4],输出矩阵Q、K、V的维度[batch_size,raw_len,4];对矩阵Q倒数第2个维度进行扩充;扩充后Q的维度[batch_size,raw_len,1,4];矩阵K和V进行multi_section操作;section矩阵的长度为sec_len;求得注意力得分矩阵;计算得到新的矩阵维度。本发明结和序列特征把输入视为一个向量大小为4的序列,输出序列每个位置上的值均有输入序列相同位置附近的一段向量值决定,这样序列的多个输出就由多段向量确定。

主权项:1.一种采用多段自注意力机制进行测序分析的方法,其特征在于,包括以下步骤;步骤一:输入四组原始数据序列raw1、raw2、raw3、raw4;步骤二:进行数据处理,得到输入序列raw_in;步骤三:将序列raw_in进行标准化操作和位置编码;步骤四:raw_in输入3个可学习的前馈神经网络W_q、W_k、W_v,得到矩阵Q、K、V;W_q、W_k、W_v的维度[4,4],输出矩阵Q、K、V的维度[batch_size,raw_len,4];步骤五:对矩阵Q倒数第2个维度进行扩充;扩充后Q的维度[batch_size,raw_len,1,4];步骤六:矩阵K和V进行multi_section操作;section矩阵的长度为sec_len,通常为奇数;步骤七:求得注意力得分矩阵attention_score;步骤八:根据求得的注意力得分矩阵计算得到新的矩阵维度。

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