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用于单通道全细胞分割的系统和方法 

申请/专利权人:分子装置有限公司

申请日:2018-11-15

公开(公告)日:2024-06-25

公开(公告)号:CN111448582B

主分类号:G06T7/00

分类号:G06T7/00;G06T7/11;G06T7/143;G06T7/194;G06T7/136

优先权:["20171116 US 15/814511"]

专利状态码:有效-授权

法律状态:2024.06.25#授权;2021.09.17#专利申请权的转移;2020.11.06#实质审查的生效;2020.07.24#公开

摘要:本公开涉及用于生物样本的样本图像的单通道全细胞分割的计算机实现系统及其关联方法。可利用一个或多个非核细胞标记着色剂对生物样本染色,以及该系统和方法配置成将利用一个或多个非核细胞标记着色剂所染色的生物样本的样本图像变换为被分割的图像,所述被分割的图像具有一个或多个细胞,所述一个或多个细胞具有所描绘的核区域和细胞质区域。

主权项:1.一种将利用一个或多个非核细胞标记着色剂所染色的生物样本的样本图像变换为被分割的图像的计算机实现方法,所述被分割的图像包括具有所描绘的核区域和细胞质区域的一个或多个细胞,所述方法包括:a提供计算机系统,所述计算机系统具有:处理器,所述处理器配置成执行指令;以及存储器或存储装置,所述存储器或存储装置在操作上耦合到所述处理器,其中所述存储器和所述存储装置中的至少一个配置成存储:从包括生物样本的多个训练图像的训练数据所生成的模型,所述训练图像包括被识别为核、细胞和背景中的至少一个的区域;利用所述一个或多个非核细胞标记着色剂所染色的所述生物样本的样本图像;以及处理器可执行指令,b在所述存储器或所述存储装置中访问所述模型以及利用所述一个或多个非核细胞标记着色剂所染色的所述生物样本的样本图像;c通过将所述模型应用于所述样本图像来生成包括预测核区域的核概率图以及包括预测细胞区域的细胞概率图;d由所述处理器从所述核概率图中提取二元核掩膜;e由所述处理器从所述二元核掩膜中提取核种子图,所述核种子图包括通过所描绘的核区域所分离的所提取单独核种子;f由所述处理器将所提取核种子应用于所述样本图像;以及g将所述样本图像变换为所述被分割的图像,所述被分割的图像包括具有所描绘的核区域和细胞质区域的一个或多个细胞。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 分子装置有限公司 用于单通道全细胞分割的系统和方法

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