龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
申请/专利权人：上海交通大学
申请日：2024-04-02
公开（公告）日：2024-06-28
公开（公告）号：CN118262807A
主分类号：G16C10/00
分类号：G16C10/00;G16B35/00
优先权：
专利状态码：在审-公开
法律状态：2024.06.28#公开
摘要：本发明涉及化学信息学技术领域，提供了一种开发碱基特异性力场参数的方法，包括以下步骤：S1、计算碱基配对能量项；S2、模拟计算特异能量项；S3、引入分子力场：将配对能量项BP‑fix和BS‑CMAP参数加入到现有的碱基特异性力场中。本发明通过引入额外能量项BP‑Fix和BS‑CMAP，提升了模拟的准确度和采样效率，同时引入的额外能量项对于其他RNA力场开发也有着借鉴价值；对于研究RNA动态系综结构功能机制、开发RNA靶向药物、研发RNA疗法等都具备重要帮助，有利于核酸医疗产业发展。
主权项：1.一种开发碱基特异性力场参数的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、计算碱基配对能量项：在溶液相下对RNA碱基配对二聚体进行扫描计算分子间距离的量子力学能量和分子力学能量，基于量子力学能量和分子力学能量计算谐波约束能项并制定配对能量项BP-fix，RNA碱基配对包括AU碱基对、GC碱基对和G-U碱基对；S2、模拟计算特异能量项：对AAAA、CCCC、GGGG、UUUU四个四核苷酸体系上进行带溶质回火的REST2模拟，并基于REST2模拟提取参考副本的轨迹，提取模拟结构，采用重加权方法，基于现有力场参数下的收敛构象系综，对各个构象进行重新加权计算，然后对四个四核苷酸体系分别进行gamma-delta二面角能量矫正，相应生成四套碱基特异性的BS-CMAP参数；S3、引入分子力场：将配对能量项BP-fix和BS-CMAP参数加入到现有的碱基特异性力场中。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海交通大学 一种开发碱基特异性力场参数的方法
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号