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一种基于软件分析的STR母源污染检测系统 

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申请/专利权人:杭州杰毅麦特医疗器械有限公司

摘要:本发明公开了一种基于软件分析的STR母源污染检测系统,具体涉及生物检测技术领域:通过建立标准参考库包括标定峰的特征数据,获取电泳图谱信息,利用自动化峰识别算法对电泳图谱中的峰进行自动识别,提取电泳图谱中峰的峰顶偏移率、峰形曲度变化速率,结合标定峰的特征数据,所述特征数据包括电泳频率偏差指数,构建异常检测模型,将峰顶偏移率、峰形曲度变化速率以及电泳频率偏差指数输入到异常检测模型中进行综合计算,根据计算结果,确定电泳图谱中的异常峰,并对异常峰所在的位置和特征进行标记,确定母源污染区域,异常检测模型的建立有助于进行质量控制,及时发现潜在的异常情况,提高实验结果的可靠性和准确性。

主权项:1.一种基于软件分析的STR母源污染检测系统,其特征在于:包括识别模块、处理模块,计算模块以及异常标记模块;识别模块:建立标准参考库,所述参考库包括标定峰的特征数据,获取电泳图谱信息,利用自动化峰识别算法对电泳图谱中的峰进行自动识别;处理模块:提取电泳图谱中峰的实时变化数据,所述实时变化数据包括峰顶偏移率、峰形曲度变化速率,结合标定峰的特征数据,所述特征数据包括电泳频率偏差指数,构建异常检测模型;峰顶偏移率的获取逻辑为:使用峰定位算法,在电泳图谱中找到每个峰的顶点位置,确定峰的顶点,记录个峰的顶点位置,将其表示为电泳图谱的时间轴上的坐标,计算每个峰顶点的坐标值,选择个峰的顶点位置作为基准的峰,计算峰顶偏移率,计算表达式为:,式中,为峰顶偏移率,为相邻两个峰之间的峰顶偏移率,计算表达式为:,式中,峰顶位置坐标值,为基准峰顶位置坐标值;峰形曲度变化速率的获取逻辑为:获取每个峰形弯曲时长,以及对应时间段内峰形,峰形为每个峰峰值改变的数据点,获取设置的峰形弯曲时长、内峰形,计算得到峰形弯曲时长偏差值Sp、内峰形偏差值kp,计算峰形曲度变化速率,计算表达式为,,式中,为峰形曲度变化速率,为第个样本区域时间,s为样本总采集时间,k,s均为大于0的正整数;电泳频率偏差指数的获取逻辑为:计算电泳图谱中峰的数量,p为大于0的正整数,获取x时间段内电泳图谱中发生电泳的时间戳和频率,建立电泳频率集合,获取最大电泳频率,最小电泳频率,计算平均电泳频率,获取电泳频率大于最大电泳频率的次数为J,电泳频率小于最小电泳频率的次数为T,获取实时的电泳图谱中的电泳频率,计算电泳频率偏差指数,计算公式为:,式中,为电泳频率偏差指数;计算模块:将峰顶偏移率、峰形曲度变化速率以及电泳频率偏差指数输入到异常检测模型中进行综合计算;综合计算峰顶偏移率、峰形曲度变化速率以及电泳频率偏差指数后构建数据评估模型,模型计算表达式为:,式中,为异变系数,为峰顶偏移率、峰形曲度变化速率以及电泳频率偏差指数的比例系数,且0;异常标记模块:根据计算结果,确定电泳图谱中的异常峰,并对异常峰所在的位置和特征进行标记,确定母源污染区域。

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权利要求:

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