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申请/专利权人:中国农业科学院农业基因组研究所
摘要:本发明公开一种高通量基因组表观遗传修饰图谱绘制方法、试剂盒及装置。本发明的方法通过对DNA的3’端进行单链多核苷酸分子连接,连接的多个样本DNA可以混合一起,针对多种修饰,混合的样本分成多个组份,实现多样本同步免疫共沉淀捕获携带修饰的DNA片段,再构建二代测序文库,实现全基因组水平DNA修饰图谱的绘制。本发明的方法大大提升了建库通量,具有建库效率高、建库成本低的优点。
主权项:1.一种高通量基因组表观遗传修饰图谱绘制方法,其特征在于,包括以下步骤:1提取基因组DNA样本,随后进行片段化;2利用单链形式的连接子与片段化的DNA样本进行连接反应,其中所述连接子包括第一多核苷酸分子和第二多核苷酸分子的组合,所述第一多核苷酸分子具有以下所示的序列:5’-M1CAGCGATCGACNxAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAddC-3’,ddC表示双脱氧胞嘧啶核苷,Nx表示具有x个相同或不同碱基的标签序列,x为大于等于4的整数;所述第二多核苷酸分子具有以下所示的序列:5’-M2-GTCGATCGCTCCCCCC-M3-3’;3混合连接有所述连接子的DNA样本,根据预先确定数量的修饰种类将混合后的样本均分;4对均分后的样本进行免疫共沉淀捕获,对捕获后的DNA进行文库构建、文库扩增和测序;和5对测序得到的数据进行拆分和分析。
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权利要求:
百度查询: 中国农业科学院农业基因组研究所 一种高通量基因组表观遗传修饰图谱绘制方法、试剂盒及装置
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