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基于SIR模型的动物布鲁氏菌病免疫效果评价方法、存储介质及装置 

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申请/专利权人:广东南星数字科技有限公司;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

摘要:本发明涉及基于SIR模型的动物布鲁氏菌病免疫效果评价方法、存储介质及装置,根据全国、辖区或者养殖场内客观的临床等参数量化评估布病免疫的效果,该方法能客观、量化地评价动物布病免疫疫苗后防控效果,为地方政府制定布病防控策略和防控措施提供有益的重要参考。避免了对传播效果评价的主观性,结合疾病传播模型与微分方程模型,丰富了评估布病传播的研究方法,具有很强的实用性。

主权项:1.一种基于SIR模型的动物布菌病免疫效果评价方法,该方法包括以下步骤:步骤1:采集日均净进口量A、日均进口量i、出口量o、因布病的流产率m和接种布病活疫苗的比例r以及起始状态的易感动物群体数量S0、免疫动物群体数量R0的数据和预测的天数t及从最初发现疫情至当下期间每一次检测结果中的易感个体数S、患病个体数I和免疫个体数的数据R以及之前4年的每一年的传染率a、出生率b和自然死亡率d、隔离扑杀率e等历史数据;步骤2:输入之前4年每一年的传染率a、出生率b和自然死亡率d的历史数据,建立灰度预测模型预估本年份的传染率a、出生率b、自然死亡率d、隔离扑杀率e的数据;其中灰度预测模型包括以下步骤:步骤a:将原始数据加工成原始数据列,即将步骤1收集的每一项指标的历史数据分别看作不同的原始数据列,以传染率为例,传染率的历史数据按年份排列可以构成一个原始数据列,并判断该数列能否做灰度预测,对于每一个原始数据列,可以设其为x0=x01,x02,…x0n,计算数列的级比λk=x0k-1x0k,k=2,3,...,n1其中x表示给定数列;λ表示级比;k表示具体数列,n表示最大数列,如果所有的级比都落在可容覆盖区间X=e-2n+1,e+2n+1内,则数列x0可以建立GM1,1模型且可以进行灰色预测,否则,对数据做适当的变换处理,通常的数据变换包括平移变换、对数变换、方根变换和数据平滑,步骤b:建立差分微分方程并求解,可以设x0=x01,x02,…x0n满足上面的要求,以它为数据列建立GM1,1模型x0k+az1k=b2用回归分析求得a,b的估计值,于是相应的白化模型为dx1tdt+ax1t=b3解为x1t=x01-bae-at-1+ba4其中a为传染率a、b为出生率,于是得到预测值 从而相应地得到预测值: 步骤c:检验预测值,可以利用残差检验,计算相对残差 如果对所有的|εk|0.1,则认为到达较高的要求;否则,若对所有的|εk|0.2,则认为达到一般要求;步骤3:建立如下传播模型: 输入最初发现疫情至当下期间每一天的易感个体数S、患病个体数I和免疫个体数R的数据,可以设定搜索初值为r=1,n=0,在搜索区间[0,1]内利用Levenberg-Marquardt算法反演出日均丧失免疫能力的个体比例n、疫苗起效概率p和因布病的流产率m的最优参数解,Levenberg-Marquardt算法原理如下:步骤a:设目标函数为y=fp,取初始点p0;终止控制常数ε,计算ε0=||y-fp0||,k=0,λ0=0.001,v=10步骤b:计算Jacobi矩阵Jk,计算 构造增量正规方程 步骤c:求解增量正规方程得到δk;如果||y-fp0+δk||<εk,则令pk+1=pk+δk,若||δk||<ε,停止迭代,输出结果;否则令λk+1=λkv,转到步骤b;如果||y-fp0+δk||≥εk,则令λk+1=λk·v,重复步骤c;步骤4:将步骤3拟合结果输入传播模型,利用计算机,使用四阶Runge-kutta法的求解模型并将结果绘制成图像;步骤5:取e=0消除人工隔离扑杀因素的影响,之后分别取r=0输入模型,求解方程组,得到无疫苗情况下疾病发展趋势;取r=1输入模型,求解方程组,得到疫苗接种率达到100%情况下疾病发展趋势;步骤6:依据计算无免疫情形下每日发病率f1t和100%免疫情形下发病率f2t;利用公式计算疫苗效果指数M,利用公式计算疫苗保护率N;步骤7:利用 得到疫苗免疫效果的综合得分P,并依据得分划分以下分组:0~20分:较差;20~40分:一般;40~60分:好;60~80分:较好;80~100分:非常好。

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百度查询: 广东南星数字科技有限公司 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 基于SIR模型的动物布鲁氏菌病免疫效果评价方法、存储介质及装置

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