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申请/专利权人:首都儿科研究所
摘要:本发明公开了一种用于核酸检测的CRISPR介导的单管一步法检测方法,具体地,其包括:(1)将待测样本的DNA模板、MCDA引物、DNA聚合酶、ApaCas12b‑gRNA复合物、荧光探针混合,得到反应体系;(2)在恒定温度下,将(1)中反应体系进行MCDA介导的等温扩增、基于CRISPRCas12b的反式切割反应;所述的MCDA引物包括置换引物、扩增引物、交叉引物,所述的交叉引物包含PAM位点,ApaCas12b‑gRNA复合物中gRNA与靶序列互补,所述的荧光探针为ssDNA探针。
主权项:1.一种非诊断目的的基于CRISPR的单管一步法检测肺炎支原体靶序列的方法,其包括:(1)将待测样本的DNA模板、MCDA引物、DNA聚合酶、AapCas12b-gRNA复合物、荧光探针混合,得到反应体系;(2)在恒定温度下,将(1)中反应体系进行MCDA介导的等温扩增、基于CRISPRCas12b的反式切割反应;所述的MCDA引物包括置换引物、扩增引物、交叉引物,所述的交叉引物包含PAM位点,AapCas12b-gRNA复合物中gRNA与靶序列互补,所述的荧光探针为ssDNA探针;所述的置换引物包括F1和F2,所述的扩增引物包括C1,D1,R1,C2,D2和R2,所述的交叉引物包括CP1*和CP2;所述的F1的序列如SEQIDNO.1所示,所述的F2的序列如SEQIDNO.2所示,所述的C1的序列如SEQIDNO.6所示,所述的D1的序列如SEQIDNO.7所示,R1的序列如SEQIDNO.8所示,所述的C2的序列如SEQIDNO.9所示,所述的D2的序列如SEQIDNO.10所示,所述的R2的序列如SEQIDNO.11所示,所述的CP1*的序列如SEQIDNO.4所示,所述的CP2的序列如SEQIDNO.5所示;所述的AapCas12b-gRNA复合物中的gRNA的序列如SEQIDNO.12所示;所述的荧光探针的序列如SEQIDNO.13所示。
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