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一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用 

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申请/专利权人:吉林省农业科学院

摘要:本发明公开了一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。本发明以延黄牛DNA为模板,通过HRM分型技术检测ARID5B基因的多态性,再通过单因素方差分析该基因的多态性与延黄牛肉用性状的相关性。本发明结果可为延黄牛肉质改良和有效遗传标记基因的筛选提供参考依据。

主权项:1.一种用于检测影响延黄牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点的引物对在筛选高肌内脂肪含量的延黄牛中的应用,其特征在于,所述的引物对序列为:ARID5B-HRM-F10:5’-AAAAGAGAATGCCCCAAAG-3’;ARID5B-HRM-R10:5’-CTGTAGAGGAGCACAACT-3’;所述的影响延黄牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,位于ARID5B基因第10外显子261bp处;具有该基因突变位点的核苷酸序列分别为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2;延黄牛ARID5B基因第10外显子261bp处存在AG突变,含有三种基因型,分别为AA基因型、AG基因型和GG基因型,其中GG基因型为高肌内脂肪含量的判断标准。

全文数据:一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用技术领域本发明涉及延黄牛品种培育技术领域,尤其涉及一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用。背景技术延黄牛因其适应性强、生长速度快、产肉率高和具有独特的肉质风味等优点越来越受到人们的关注,是吉林省延吉市饲养的主导肉牛品种之一。延黄牛品种来源是由延黄牛和利木赞经过27年杂交合成、横交固定和群体继代选育而成的新型培育品种。富含AT相互作用功能域5BAT-richinteractivedomain5B,ARID5B基因位于牛28号染色体上,含有13个外显子,共编码939个氨基酸,是ARID基因家族重要的一员。ARID包含15种人类特殊蛋白质,根据个体成员之间序列同源性差异可将其分为7个亚型,分别是ARID1、ARID2、ARID3、ARID4、ARID5、JARID1和JARID2。ARID5B和ARID5A也是ARID家族成员,而ARID5B也被称为调制器识别因子2modulaterrecognitionfactor2,MRF2能与巨细胞病毒的增强子结合并抑制其活性。有研究报道ARID5B基因编码的转录因子在细胞生长调控过程、细胞型基因表达和胚胎发育过程中发挥着重要的作用。早期研究发现,人ARID5B基因的5个SNP位点与儿童急性淋巴细胞白血病相关,还发现该基因与人类动脉粥样硬化有关。拷贝数变异CNV与多种人类疾病包括肥胖的病因有关,Selvanayagam等学者对罕见CNV肥胖儿科病例个体中发现ARID5B是一种潜在的新型肥胖候选基因。敲除调节剂识别因子-2Mrf-2的小鼠体型消瘦,白色脂肪组织显著减少,Mrf2可能是脂肪细胞分化的潜在调节因子和瘦蛋白的潜在抑制因子。ARID5B在脂肪细胞产热调节途径发挥着重要作用,具有显著的肥胖和抗肥胖作用。脂肪是由脂肪细胞组成,是动物体内能量储存和内分泌功能的主要器官,不仅在调节新陈代谢中发挥重要作用,而且还调节动物肥胖。脂肪形成是一个涉及细胞增殖、分化、激素调节和基因表达调控等复杂过程。牛肉品质受许多主效基因的影响,例如脂肪酸结合蛋白FABP基因影响牛肉的肌内脂肪含量和钙蛋白酶Calpain基因影响牛肉的嫩度。目前已证实ARID5B基因参与脂肪酸代谢,但是对于该基因在牛肉质方面的研究尚未见报道。肌内脂肪是影响牛肉品质的一个关键因素,而脂肪形成过程受许多基因调控。L.A.Aqrawi等研究发现ARID5B是影响脂肪组织发育和减少线粒体脂肪酸β-氧化的关键基因。J.Murray等研究报道ARID5B在脂肪生成和软骨形成中具有重要功能,并且该基因的抑制导致原代骨骼肌细胞分化也受到抑制,说明该基因在骨骼肌肌肉生成中也发挥着重要的作用。L.L.Sun等还研究发现ARID5B基因的四个单核苷酸多态性SNP位点与2型糖尿病T2DM和人类脂质代谢相关。本研究发现延黄牛ARID5B基因第10外显子261bp处存在AG突变,且存在三种基因型,AA是优势等位基因型,A为优势等位基因。三种基因型与延黄牛肉用性状中的肌内脂肪存在显著相关性P0.05。以上所述,仅为本发明较佳的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,根据本发明的技术方案及其发明构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本发明的保护范围之内。序列表吉林省农业科学院一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点及其应用20102SIPOSequenceListing1.01199DNA人工序列Artificialsequence1gttaatcctgccgtatgaaaggtttattaaaggagaggaagataagcccctgcctccaat60caaacctcgaaaacaggagaacaattcacaggaaaacgagaataagacaaaagtatcagg120agccaaacgcatcaaacatgaaatctctaagagcaagaaagaaaaagagaatgccccaaa180gccccaggatgcatcagag1992199DNA人工序列Artificialsequence2gttaatcctgccgtatgaaaggtttattaaaggagaggaagataagcccctgcctccaat60caaacctcgaaaacaggagaacaattcacaggaaaacgagaataagacaaaagtatcagg120agccaaacgcatcaaacatgaaatctctaagagcaagaaagaaaaagagaatgccccaaa180gccccagggtgcatcagag199

权利要求:1.一种影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,其特征在于,位于ARID5B基因第10外显子261bp处。2.如权利要求1所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点,其特征在于,具有该基因突变位点的核苷酸序列分别为SEQIDNo.1和SEQIDNo.2。3.一种ARID5B突变基因,其特征在于,该突变基因在ARID5B基因第10外显子261bp处具有基因突变位点。4.一种与权利要求1所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点完全连锁的分子标记,其特征在于,该分子标记为ARID5B-HRM-10,其引物序列为:ARID5B-HRM-F10:5’-AAAAGAGAATGCCCCAAAG-3’;ARID5B-HRM-R10:5’-CTGTAGAGGAGCACAACT-3’。5.如权利要求1所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因突变位点在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。6.如权利要求4所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因分子标记在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。7.如权利要求4所述的影响肉牛肌内脂肪含量的ARID5B基因分子标记的引物在延黄牛分子标记辅助育种中的应用。

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