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申请/专利权人：江西师范大学
申请日：2023-10-25
公开（公告）日：2023-11-24
公开（公告）号：CN117116361A
主分类号：G16B45/00
分类号：G16B45/00;G16B30/00
优先权：
专利状态码：有效-授权
法律状态：2024.01.26#授权;2023.12.12#实质审查的生效;2023.11.24#公开
摘要：本发明公开了一种基于固定框架的12sRNA二级结构可视化方法，依据12sRNA序列的茎环结构标定12sRNA二级结构可视化图框架，根据12sRNA序列的点括号序列，提取发卡环、内环和多环的位置下标分别存入发卡环、内环、多环位置下标二维数组，给内环位置下标二维数组设置标记；然后拆分发卡环、多环序列和带标记的茎‑内环序列，并重排茎‑内环序列；根据茎‑内环序列与茎环位置文档绘制茎‑内环部分；根据发卡环序列与发卡环位置文档绘制发卡环部分；根据多环序列与多环位置文档绘制多环部分。本发明能够根据12sRNA的碱基序列以及点括号序列可视化12sRNA序列的二级结构图片。
主权项：1.一种基于固定框架的12sRNA二级结构可视化方法，其特征在于，包括：标定框架步骤：依据12sRNA序列的茎环结构标定12sRNA二级结构可视化图框架，包括给出用于放置茎-内环序列的茎环位置文档、用于放置发卡环序列的发卡环位置文档和用于放置多环序列的多环位置文档；拆分准备步骤：根据12sRNA序列的点括号序列，提取发卡环、内环和多环的位置下标分别存入发卡环位置下标二维数组、内环位置下标二维数组、多环位置下标二维数组；标记步骤：遍历12sRNA序列的点括号序列，给内环位置下标二维数组设置标记；拆分步骤：根据发卡环位置下标二维数组提取碱基序列中的发卡环序列，根据多环位置下标二维数组提取碱基序列中的多环序列；根据带标记的内环位置下标二维数组将12sRNA序列的碱基序列一边拆分一边打上标记最后形成带标记的茎-内环序列的一维数组；重排步骤：通过内环和相关茎的标记重排茎-内环序列的一维数组，得到重排后的茎-内环序列；可视化步骤：根据茎-内环序列与茎环位置文档绘制12sRNA二级结构可视化图形的茎-内环部分；根据发卡环序列与发卡环位置文档绘制12sRNA二级结构可视化图形发卡环部分；根据多环序列与多环位置文档绘制12sRNA二级结构可视化图形的多环部分；最后形成12sRNA二级结构可视化图形。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 江西师范大学 一种基于固定框架的12sRNA二级结构可视化方法
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