申请/专利权人：吉林大学

申请日：2021-09-07

公开（公告）日：2024-05-17

公开（公告）号：CN113870950B

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B25/00

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.05.17#授权;2022.01.21#实质审查的生效;2021.12.31#公开

摘要：本发明公开了一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法，所述识别系统包括：输入单元，其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据；微处理器，其连接所述输入单元；存储单元，其连接所述微处理器；处理单元，其连接所述微处理器，用于处理数据并得出识别结果；其中，所述处理单元包括：预处理单元，其从所述存储单元中获取所述多组学数据，并进行预处理；网络构建单元，其获取预处理后的多组学数据，处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络；致病因子挖掘单元，其输入所述多组学分层异质互作网络，输出致病sRNA调控网络；以及关键sRNA识别单元，其接收致病sRNA调控网络，并进行稻瘟菌关键sRNA识别，得到识别结果。

主权项：1.一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统，其特征在于，包括：输入单元，其用于输入稻瘟菌和水稻多组学数据；其中，所述多组学数据包括：基因组学数据、转录组学数据、蛋白组学数据和代谢组学数据；微处理器，其连接所述输入单元；存储单元，其连接所述微处理器；处理单元，其连接所述微处理器，用于处理数据并得出识别结果；其中，所述处理单元包括：预处理单元，其从所述存储单元中获取所述多组学数据，并进行预处理；网络构建单元，其获取预处理后的多组学数据，处理得到稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络；构建稻瘟菌和水稻多组学分层异质互作网络，包括如下步骤：步骤1、在基因组学中，建立稻瘟菌基因和水稻基因互作调控网络；在转录组学中建立稻瘟菌sRNA和水稻mRNA互作网络；在蛋白组学中，建立稻瘟菌蛋白和水稻蛋白组数据互作网络；在代谢组学中，建立水稻和稻瘟菌代谢组学关系网络；步骤2、采用基于多组学数据的聚类降维算法将所述稻瘟菌基因和水稻基因互作调控网络、所述稻瘟菌sRNA和水稻mRNA互作网络、所述稻瘟菌蛋白和水稻蛋白组数据互作网络、所述水稻和稻瘟菌代谢组学关系网络进行纵向整合，建立初级稻瘟菌-水稻分层异质互作网络；步骤3、对建立的初级稻瘟菌-水稻分层异质互作网络分别通过上下游组学数据库进行扩充，获取相应的调控网络作为演示网络；对所述初级稻瘟菌-水稻分层异质互作网络进行优化，完善稻瘟菌-水稻互作知识数据库，得到稻瘟菌-水稻多组学分层异质互作网络；致病因子挖掘单元，其输入所述多组学分层异质互作网络，输出致病sRNA调控模块；以及关键sRNA识别单元，其接收致病sRNA调控模块，并进行稻瘟菌关键sRNA识别，得到识别结果。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 吉林大学 一种稻瘟菌侵染水稻关键sRNA识别系统及识别方法

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