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一种鉴定烟草突变体的HRM方法 

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申请/专利权人:云南中烟工业有限责任公司

摘要:本发明公开了一种鉴定烟草突变体的HRM方法,该HRM反应体系的构建方法是针对烟草突变群体,从扩增片段长度、染料种类和染料浓度、DNA模板浓度、引物浓度四个方面研究是否能对单碱基差异的突变体进行分型。每20μL反应体系中包括:DNA模板浓度为80~100ngμL、EvaGreenDye染料0.4μL、0.3μmolL的正向和反向引物,剩余ddH2O补齐。本发明的HRM体系,具有灵敏性和简便性,在添加饱和染料的PCR产物中直接进行高分辨率熔解曲线的采集,且PCR体系成分的存在不会影响荧光信号采集,检测结果中几乎不出现假阳性;高通量、成本低,检测方法便捷;适用于大规模分子辅助育种的生产实践中。

主权项:1.一种鉴定烟草突变体的HRM反应体系的构建方法,其特征在于,针对烟草突变群体,从扩增片段长度、染料种类和染料浓度、DNA模板浓度、引物浓度四个方面研究是否能对单碱基差异的突变体进行分型,包括以下步骤:1扩增片段长度:设置包含SNP位点的扩增子长度依次为201bp,283bp,430bp,506bp,599bp,763bp,801bp,839bp;2引物浓度:设置为0.1μmolL、0.3μmolL、0.5μmolL、0.7μmolL、0.9μmolL,所述引物浓度为0.3μmolL~0.5μmolL;3DNA模板浓度:设置为20ngμL、40ngμL、80ngμL、100ngμL;4染料的种类:分别使用非饱和染料SYBRGreenI和饱和染料20×EvaGreenDyeBiotium,Hayward,USA,检测两种染料对HRM熔解曲线信号采集的影响;5染料的浓度:染料添加用量依次为0.2μL、0.4μL、0.6μL、0.8μL。

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权利要求:

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