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在菌株水平快速检测鉴定鼠李糖乳杆菌HN001的两组引物探针组合及方法 

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申请/专利权人:中国检验检疫科学研究院

摘要:本发明涉及两组鼠李糖乳杆菌HN001的特异性引物及探针,这两组引物探针菌可以在菌株水平快速、准确地鉴定出鼠李糖乳杆菌HN001。本发明还涉及用于测定鼠李糖乳杆菌HN001的qPCR检测方法,所述方法包括使用针对鼠李糖乳杆菌HN001的特异性寡核苷酸引物及探针。本发明还涉及用于鼠李糖乳杆菌HN001的qPCR检测试剂盒,所述试剂盒包括特异性寡核苷酸引物及探针。该方法利用基因组的比对,找出鼠李糖乳杆菌HN001的特异性基因,通过特异性基因进行引物设计从而实现在菌株水平对鼠李糖乳杆菌HN001的鉴定。基因组的比对结果寻找到了鼠李糖乳杆菌HN001上RepA基因和ferritin‑likedomain‑containing基因,通过序列相似性比对确认其特异性,然后设计特异性的引物和探针。该方法可通过qPCR对食品中或保健食品中的鼠李糖乳杆菌HN001进行鉴定,通过观察qPCR结果中的扩增曲线和Ct值来判断待测样品是否为鼠李糖乳杆菌HN001。

主权项:1.两种鼠李糖乳杆菌HN001鉴定用引物探针,以RepA基因为目标序列的引物为正向引物5’-GCTTAGCTTTCTCTACTGGCGA-3’;反向引物5’-GTTTGCACCAGATCCCCTCA-3’;探针5’-FAM-AAGCGCCAAGCCTTACGTGAT-BHQ1-3’;以ferritin-likedomain-containing为目标序列的引物为正向引物5’-CATCCAAGCCTTCTCGTGGT-3’;反向引物5’-ACAACATTTGGTTGGCCTGCF-3’;探针5’-VIC-GCAAGGCCTGCAGAGTAGCGA-BHQ1-3’。所述实时荧光PCR方法为Taqman荧光探针法。

全文数据:

权利要求:

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