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申请/专利权人:武汉明德生物科技股份有限公司
摘要:本发明公开了一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法,具体为:基于各病原微生物基因组上靶向区域设计的引物进行多重扩增,扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序,将测序结果比对至针对病原微生物靶向区域构建的索引文件上,并对比对后的文件进行特定的过滤处理,根据过滤后测序结果比对至靶向区域的reads数,获得病原微生物的检出情况。通过本发明方法,可以有效减少测序结果中嵌合体等数据的干扰,从而提升病原微生物检出的准确性。
主权项:1.一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、基于各病原微生物基因组靶向区域设计的引物进行多重扩增,扩增后使用Nanopore平台建库试剂盒进行建库并上机测序,其中所述靶向区域具有保守性和特异性;S2、针对步骤S1所述靶向区域构建索引文件,所述索引文件中包括靶向区域与病原微生物物种信息的对应关系;S3、将测序结果比对至索引文件上,并对比对后的文件进行过滤处理。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 武汉明德生物科技股份有限公司 一种用于Nanopore靶向测序的嵌合体过滤方法
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