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申请/专利权人：中南大学
申请日：2024-03-14
公开（公告）日：2024-06-04
公开（公告）号：CN118136108A
主分类号：G16B30/00
分类号：G16B30/00;G16B40/00;G06N3/045;G06F17/16;G06N3/0464;G06N3/08
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.06.21#实质审查的生效;2024.06.04#公开
摘要：本发明公开了一种肽与蛋白相互作用及相应绑定残基的预测方法，包括如获取肽‑蛋白质相互作用及对应的相互作用位点信息并构建数据集；计算肽与蛋白质的多源序列特征；构建肽残基特征、蛋白质残基特征、肽序列特征和蛋白质序列特征并映射到统一的特征维度空间得到对应的特征向量；构建肽‑蛋白质对交互图；构建肽与蛋白质相互作用及对应的绑定位点预测模型并训练；采用训练后的肽与蛋白质相互作用及对应的绑定位点预测模型进行实际的肽‑蛋白质对相互作用结果及发生相互作用的残基位点的预测。本发明还公开了一种实现所述肽与蛋白相互作用及相应绑定残基的预测方法的系统。本发明的可靠性更高，而且精确性更好。
主权项：1.一种肽与蛋白相互作用及相应绑定残基的预测方法，包括如下步骤：S1.获取现有且已知的肽-蛋白质相互作用及对应的相互作用位点信息，构建数据集；S2.根据步骤S1获取的数据信息，计算得到肽与蛋白质的多源序列特征；S3.根据步骤S2获取的数据，构建肽残基特征、蛋白质残基特征、肽序列特征和蛋白质序列特征，映射到统一的特征维度空间并得到对应的特征向量；S4.根据步骤S3得到的特征向量，构建肽-蛋白质对交互图；S5.构建肽与蛋白质相互作用及对应的绑定位点预测模型；S6.采用步骤S1～S4得到的数据，对步骤S5构建的模型进行训练；S7.采用步骤S6得到的训练后的肽与蛋白质相互作用及对应的绑定位点预测模型，进行实际的肽-蛋白质对相互作用结果及发生相互作用的残基位点的预测。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中南大学 肽与蛋白相互作用及相应绑定残基的预测方法及系统
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