申请/专利权人:中国科学院深圳先进技术研究院
申请日:2022-11-18
公开(公告)日:2024-05-21
公开(公告)号:CN118057542A
主分类号:G16B30/10
分类号:G16B30/10;G16B40/00;G16B50/30;G06N3/045;G06N3/08
优先权:
专利状态码:在审-实质审查的生效
法律状态:2024.06.07#实质审查的生效;2024.05.21#公开
摘要:本发明公开了一种蛋白残基接触预测方法及相关设备,方法包括:获取待预测蛋白质的氨基酸序列的多序列比对文件,根据氨基酸序列的多序列比对文件构建输入特征,其中,输入特征包括互补的第一特征和第二特征,氨基酸序列的第一特征基于氨基酸序列的多序列比对结果的二维直接耦合特征得到,氨基酸序列的第二特征基于该氨基酸序列一维特征得到;将输入特征输入至已训练的神经网络模型,根据神经网络模型的输出结果得到待预测蛋白质的残基距离预测结果,根据残基距离预测结果得到残基接触预测结果。本发明能够提升蛋白残基接触预测的精度。
主权项:1.一种蛋白残基接触预测方法,其特征在于,所述方法包括:获取待预测蛋白质的氨基酸序列的多序列比对文件,根据所述多序列比对文件构建输入特征,其中,所述输入特征包括互补的第一特征和第二特征,氨基酸序列的所述第一特征基于该氨基酸序列的多序列比对结果的二维直接耦合特征得到,氨基酸序列的所述第二特征基于该氨基酸序列的一维特征得到;将所述输入特征输入至已训练的神经网络模型,根据所述神经网络模型的输出结果得到所述待预测蛋白质的残基距离预测结果,根据所述残基距离预测结果得到残基接触预测结果。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学院深圳先进技术研究院 一种蛋白残基接触预测方法及相关设备
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