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基于MSI-H的结肠癌患者免疫治疗评估方法、系统和装置 

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申请/专利权人:复旦大学附属肿瘤医院

摘要:本发明提供一种基于MSI‑H的结肠癌患者免疫治疗评估方法、系统和装置,用以根据结直肠癌CRC患者的微卫星不稳定高MSI‑H和微卫星稳定MSS评估免疫治疗反应的可靠性,本发明综合患者元信息、突变信息、临床取得的mIHC信息建立模型,采用非线性机器学习方式捕捉复杂信号,集成多个不同复杂度的模型于一身,健壮性高,能够适应多种输入值缺省的情况,从而在实际推广中更容易展开。

主权项:1.基于MSI-H的结肠癌患者免疫治疗评估方法,用以根据结直肠癌CRC患者的微卫星不稳定高MSI-H和微卫星稳定MSS评估免疫治疗反应的可靠性,其特征在于,包括:S1,建立模型特征工程,将患者部分元信息独热编码为拟似变量,并将每个样本突变图谱预处理成3个衍生特征,即平均后验突变概率和联合后验突变概率PMSI|M和一个反映突变图谱基因功能类别各分辨率层级的多维向量特征变量,建立突变景观综合衍生特征;S2,根据患者元信息、突变景观综合衍生特征和蛋白质染色结果的不同组合训练多个XGboost模型,采用多个随机数训练每个XGboost模型的亚模型组;S3,基于优化后的亚模型组计算预测结果,取居中的结果平均值作为最终预测,形成MSI-H评分。

全文数据:

权利要求:

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